小RNA 克隆和高通量测序的结合是纯化和鉴别细胞或组织中小RNA 的有效先进技术。本方案描述了用于Illumina Genome Analyzer 高通量分析的19 ~ 29 个核苷酸小RNA 的克隆方法,通过聚丙烯酰胺凝胶从总RNA 样品中分离纯化小RNA, 并进行两步连接反应:小RNA3′ 端与5′ 腺苷酸DNA 连接物的连接;以 …
阅读更多 »封闭问题可大可小,千万不能掉以轻心
Western Blot是检测一个基因的表达产物是否正确,或者比较表达产物量的相对变化的首选方法,也是实验室常见的实验方法。 完整的Western实验过程比较长,做一次Western也不容易。有结果当然是好的,没有结果也是常有的事,出现各种烦心结果也是时有发生。其中最常见的一种就数显色后背景高了。背景高,目的蛋白颜色对比不明显,要么看不清,图片展示不理想,更 …
阅读更多 »慢病毒感染,胶体金测出来很高,可感染效果很差的原因
慢病毒感染效率低,尽管用胶体金测试显示滴度很高,可能有以下几个原因: 病毒颗粒质量:虽然胶体金检测显示病毒滴度很高,但这并不意味着所有的病毒颗粒都是功能性的。有可能病毒颗粒已经失活或者结构受损,无法有效感染目标细胞。 病毒浓度与效价的差异:胶体金检测主要测量病毒颗粒的数量,但这些颗粒不一定都具有感染性。有效感染的病毒颗粒(感染性单位)可能比实际检测的数量要低 …
阅读更多 »测序胶的灌制、电泳及处理
推荐用6 %丙烯酰胺、非梯度胶为起点。可使用两种胶:一种在相对短的时间获得较短的寡核苷酸信息;另一种是用较长时间以使较长的寡核苷酸得到最大限度的分离。这两种凝胶分离过程,采用6 %丙烯酰胺,可以从一套测序反应中获得300~350 个碱基的序列信息。另一种可选的方案是使用两种不同浓度的胶,使较短片段和较长片段的寡核苷酸得到最大限度的分离。 材料 盛于喷射洗瓶的 …
阅读更多 »western-blot化学发光(ECL)为什么会淬灭?
做Western Blot发光实验经常有“淬灭”的情况发生,经常有朋友反映,加发光试剂后立刻可以看到很明显的亮光,可亮光很快就消逝了,压完片后,条带却很弱,甚至什么也没有。这种情况发生的原因是什么? 要解释这种情况发生的原因,必须先了解ECL化学发光的原理。一般的发光试剂含鲁米诺和H2O2、发光增强剂等物质。发光试剂中的鲁米诺被HRP和H2O …
阅读更多 »抑制miRNA 功能的反义寡核苷酸制备
本方案用于设计特异性抑制细胞内miRNA 功能的反义寡核昔酸(ASO ) 。2′-O- 甲基化修饰的反义寡核苷酸( ASO ) 可以增加其有效性和抗降解能力, 然而3’端胆固醇修饰可以促进ASO 进入细胞内。 设备 连接互联网的计算机 方法 1 从miRBase ( http://rnicroma.sanger.ac. uk/sequences …
阅读更多 »分子克隆中常用的其他酶
一、DNA 聚合酶 分子克隆中的许多步骤都涉及在DNA 聚合酶催化下的DNA 体外合成反应。这些酶作用时大多需要模板,合成产物的序列则与模板互补。大多数聚合酶优先作用于DNA 模板,但也可拷贝RNA ,尽管这时效率较低。最常用的依赖于DNA 的DNA 聚合酶是大肠杆菌DNA 聚合酶 I (全酶)、大肠杆菌DNA 聚合酶I 大片段(Klenow 片段)、T4 …
阅读更多 »western-blot实验常见问题及解答
常见问题 解决对策 两块玻璃板之间灌胶,胶总是不平 玻璃没有洗干净,应该洗得很干净 过硫酸铵和TEMED加量相对较多 加完试剂后应摇匀 总是漏胶 避免玻璃边缘(与胶条接触处)破损 将两块玻璃板摆放对齐,底部处于同一平面 膜上有明显气泡 操作时将气泡完全排除 靠膜一侧的滤纸应铺平 特异性低 优化一抗 提高一抗和 …
阅读更多 »双向电泳相关试剂配制
1. Bradford 工作液 95%乙醇 25ml 先用乙醇溶解考马斯亮兰G250,溶解完后再加磷 85%磷酸 52ml 酸,最后超纯水定容至500ml。过滤后置于棕色瓶 考马斯亮兰G250 0.035g 外加油皮纸保存(Bradford不稳定,一周内有效) 2. 裂解液 尿素 8M 硫脲 2M CHAPS 4% DTT 60 mM Tris—base 4 …
阅读更多 »建立透析的方法步骤
1. 剪下一段足够装得下要透析物质的透析袋,在每个末端留下大概2 英寸(总共留下4英寸)来捆绑透析袋。(可以买到特殊的管子来进行微量的透析。)2. 透析袋的两端都要打结,或者用透析夹封住末端。3. 用戴手套的手打开透析袋的一个末端,另一个手拿住透析袋,把样品认真地装入透析袋中。4. 扎住或者夹住透析袋的末端,夹住之前先挤压赶走气泡,检查渗漏,尤其注意末端。5 …
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英格恩生物技术博客 生物实验干货分享