DNA 在含有异丙醇的溶液中比在含有乙醇的溶液中难溶。乙醇沉淀法需要2 ~ 3 倍体积的乙醇,异丙醇沉淀则需要0.6 ~ 0.7 倍的体积。沉淀大体积溶液中的DNA 时,异丙醇是比较好的选择。在室温用异丙醇沉淀减少了一些蔗糖或者氯化钠和DNA 发生共沉淀的现象。但异丙醇还是有一些不足之处: 盐在35 %的异丙醇溶液中比在65 %的乙醇溶液中难溶。 DNA 沉 …
阅读更多 »2024诺贝尔化学奖之蛋白质结构预测
蛋白质结构预测(Protein Structure Prediction)是一项利用计算方法预测蛋白质分子的三维结构的技术。由于蛋白质的功能很大程度上依赖于其三维结构,预测其结构对理解生物过程、药物设计等领域具有重要意义。然而,实验确定蛋白质结构(如X射线晶体学、核磁共振等方法)耗时费力,因此计算预测成为重要替代方法。 蛋白质结构预测的主要方法 同源建模(H …
阅读更多 »验证shRNA的敲除效率时,qPCR引物怎么才能设计在靶标附近
在用 qPCR验证shRNA敲除效率 时,引物设计是非常关键的一步。你提到要“设计在靶标附近”,这个思路是对的,但还需要进一步明确几个关键点。 理解shRNA的作用机制: shRNA经过加工后变成siRNA,通过RNA干扰机制(RNAi),引导RISC复合体结合并切割目标mRNA。 切割点通常位于shRNA的互补区域中间(即靶序列中心)。 qPCR引物设计的 …
阅读更多 »体外转录法制备dsRNA中,怎么知道mRNA的靶区域在哪
在体外转录法制备dsRNA(双链RNA)的过程中,确定mRNA的靶区域是关键的一步。以下是一些常用的方法和步骤,以帮助确定mRNA的靶区域: 1. 目标基因的选择 首先,确定你想要抑制或研究的目标基因。你需要有这个基因的完整序列信息(通常从基因数据库中获得,如NCBI)。 2. 设计siRNA或shRNA序列 设计小干扰RNA(siRNA)或小发夹RNA(s …
阅读更多 »琼脂糖凝胶电泳拖尾了怎么办?
跑过琼脂糖凝胶电泳的小伙伴,是不是经常遇到过电泳拖尾的现象啊?相信不少人点头如捣蒜了。提个质粒拖尾,提个DNA拖尾,连PCR也拖尾,拖尾什么的最常见了。验证也就算了,关键是图片拍出来不好看了,发文章什么的太影响档次了。下面我就跟据自己的经验跟大家讲讲琼脂糖凝胶电泳为什么会拖尾,有不足的希望大家多多评论补足啊(三人行必有我师嘛)!! 那琼脂糖凝胶电泳为什么会拖 …
阅读更多 »原位PCR原理与操作步骤
原位PCR 在科学研究中,每一项新技术的创立都会带来一系列新的研究成果问世,从而推动着各学科的发展。纵观形态研究领域,50年代电子显微镜引入形态学观察领域,带来了从细胞水平到亚细胞水平的深入研究;60-70年代,免疫组织化学与免疫细胞化学技术的广泛应用,又将观察的水平由亚细胞结构推向了蛋白质分子水平,使细胞内众多的活性物质得以进行细胞或亚细胞水平的定位,对医 …
阅读更多 »离心机的种类
有很多关于离心机类型的描述性术语,但那些不是严格的定义。在实验室中,离心机通常以制造者的名字相称。 高速与超速离心机都带有冷冻装置,之所以需要冷冻是因为高速离心会产生热。其他离心机有带或不带冷冻装置的型号。 台式离心机, 也称为多用途离心机。不一定放在实验台上,反而经常放在桌子底下。 用途:沉淀细胞与细菌、酚抽提。 g 值与每分钟旋转次数: 角式17000 …
阅读更多 »蛋白质的长期保存——以冻干固体的形式保存
一种按适当配方制造的冻干蛋白质制剂能够在几年内保持稳定,即使是在室温(Carpenter and Chang 1996) ;然而,冻干配方的最佳溶液组成和工艺条件的研制远远超出了典型学术实验室的能力范围。一个主要的困难是大多数实验室中所用的冻干机通常没有控制样品温度的能力,不能达到低水平的残留水(如低于质量的1%~2%),而低水平的残留水是冻干产品长期保存活 …
阅读更多 »如何提高qPCR反应的灵敏度与特异性?
1. 首先确定模板RNA完整性好,无DNA污染。 2. RNA模板中不应含有扩增反应抑制剂。 3. 为了防止模板降解,在反应体系中加入RNase抑制剂RNasin。 4. 使用适量的模板RNA,模板量太多会降低特异性,太少会导致扩增不出条带或条带太弱。 5. 若模板中有二级结构,可通过提高逆转录反应温度来提高扩增效果。 6. 设计引物时,避免在引物3’端含有 …
阅读更多 »慢病毒感染,胶体金测出来很高,可感染效果很差的原因
慢病毒感染效率低,尽管用胶体金测试显示滴度很高,可能有以下几个原因: 病毒颗粒质量:虽然胶体金检测显示病毒滴度很高,但这并不意味着所有的病毒颗粒都是功能性的。有可能病毒颗粒已经失活或者结构受损,无法有效感染目标细胞。 病毒浓度与效价的差异:胶体金检测主要测量病毒颗粒的数量,但这些颗粒不一定都具有感染性。有效感染的病毒颗粒(感染性单位)可能比实际检测的数量要低 …
阅读更多 »
英格恩生物技术博客 生物实验干货分享