dsRNAdsRNA 即双链RNA , 是由两条互补链复性形成的RNA 分子,可以被Dicer 酶切割形成siRNA 。 Endo-siRNAEndo-siRNA 即内源性小干扰RNA (siRNA) ,是一类存在于几乎所有真核生物中的小干扰RNA 分子。 exo-siRNAexo-siRNA 即外源性小干扰RNA (siRNA) ,是指通过体内或者体外技术 …
阅读更多 »western-blot实验中ECL发光检测操作步骤
ECL Western特异发光检测试剂盒用于辣根过氧化物酶(HRP)标记的蛋白或核酸检测。下面以engreen的超敏型ECL发光液Enlight-Plus为例,说一下检测实验步骤。 1. 常规电泳、转膜、HRP 标记抗体或核酸探针孵育、洗膜。以下操作在室温进行。 注意:Enlight-Plus 推荐的抗体稀释度为: 储存液浓度为1mg/ml 的一抗推荐稀释度 …
阅读更多 »验证shRNA的敲除效率时,qPCR引物怎么才能设计在靶标附近
在用 qPCR验证shRNA敲除效率 时,引物设计是非常关键的一步。你提到要“设计在靶标附近”,这个思路是对的,但还需要进一步明确几个关键点。 理解shRNA的作用机制: shRNA经过加工后变成siRNA,通过RNA干扰机制(RNAi),引导RISC复合体结合并切割目标mRNA。 切割点通常位于shRNA的互补区域中间(即靶序列中心)。 qPCR引物设计的 …
阅读更多 »从革兰氏阴性菌(如E.coli)中分离DNA
从细菌中分离DNA 需要依赖SDS 和蛋白酶K 以裂解细胞。高分子质量的DNA 需要剪切(以减少它的黏性,更适合操作),用酚和氯仿提取,再用异丙醇提纯。该方案可以分离到长度为3 0 ~ 80kb 的DNA 。 试剂 乙酸铣( 5mol/L ) 细菌培养基(≥l.5mL) 培养基需要在剧烈振荡中过夜。 氯仿 乙醇(70%, 95%) 异丙醇 氯化钠( 5mol …
阅读更多 »细胞转染siRNA后,目标基因的表达反而升高的原因是什么?
siRNA转染后目标基因不降反升的现象可能由多种原因引起,常见的因素包括: siRNA设计不合理: siRNA的靶点选择不佳,未能有效靶向目标基因的mRNA,导致抑制效果差或反而激活了基因表达。可以尝试设计不同的siRNA靶点或使用更为优化的siRNA工具进行设计。 转染效率问题: 低转染效率可能导致siRNA无法进入足够多的细胞,从而未能有效抑制目标基因。 …
阅读更多 »western-blot实验成功要点
1. 样品质量。所抽取样品的蛋白含量,蛋白变性是否充分等等,还有,蛋白样品的PH值是否在7~8之间。这会直接影响到样品浓缩的效果。此外,蛋白样品是否降解、目的蛋白是否已抽取充分都会对最终结果的可靠性有影响。 2. 凝胶质量。不连续SDS-PAGE胶对凝胶的 …
阅读更多 »抗体标记的步骤
下列步骤描述了使用Cy3作为代表性标记试剂, 用荧光succinimidy l 活性酶标记羊抗体。其他水溶性荧光标记物的使用与此类似(Mujumdar et al. 1993) 抗体分离与纯化 来源于血清,腹水或培养基的抗体,在标记反应开始以前,需纯化以除去蛋白质和其他含有氨基团的分子。在与标记反应混合以前,抗体不应进行强缓冲处理,不然标记混合物会降低,所有 …
阅读更多 »测序胶的灌制、电泳及处理
推荐用6 %丙烯酰胺、非梯度胶为起点。可使用两种胶:一种在相对短的时间获得较短的寡核苷酸信息;另一种是用较长时间以使较长的寡核苷酸得到最大限度的分离。这两种凝胶分离过程,采用6 %丙烯酰胺,可以从一套测序反应中获得300~350 个碱基的序列信息。另一种可选的方案是使用两种不同浓度的胶,使较短片段和较长片段的寡核苷酸得到最大限度的分离。 材料 盛于喷射洗瓶的 …
阅读更多 »cDNA文库构建详细步骤
cDNA文库的构建分为六个阶段: 阶段1:反转录酶催化合成cDNA第一链 1.在置于冰上的无菌微量离心管内混合下列试剂进行cDNA第一链的合成: poly(A)+RNA (1μg/μl) 10μl 寡核苷酸引物(1μg/μl) 1μl 1mol/L Tris-HCl (pH8.0, 37℃) 2.5μl 1mol/L KCl 3.5μl …
阅读更多 »离心的种类和原理
离心方法主要有两种:制备型(用来分离某些颗粒)和分析型(用来了解分离颗粒的物理性质)。 分子或细胞生物学实验室中所作的决大多数离心机属于制备型离心机,而多数常规制备型离心是差速离心。 g 力和每分钟旋转次数(rpm) 是大略的值:取决于所用的离心机型号和转子。 差速离心(沉淀) 原理:样品在一定速度下离心,分成上清部分与沉淀部分。样品根据沉降速度不同得到分离 …
阅读更多 »
英格恩生物技术博客 生物实验干货分享