RNA转染

1. RNA与转染试剂比例不佳    由于RNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记，决定了RNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件，建议先进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳    调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调，但未成功转染的细胞却不受影响，这 …

这种情况可能是由多种因素引起的，以下是一些可能的原因： 转录水平和蛋白水平的不同调控机制：虽然shRNA能够有效地降低目标基因的mRNA和蛋白表达，但有时候蛋白质的功能并不完全依赖于其表达量。有可能是基因表达抑制后，细胞通过一些补偿机制（比如其他途径的上调或活化）来恢复其功能，导致表型不一致。 shRNA的特异性和脱靶效应：shRNA可能会靶向与目标基因相似 …

这是个很实际的问题。在转染实验中，荧光标记良好说明转染效率高，但如果qPCR在24小时没有观察到预期的基因敲低效果，可能存在以下几种情况： 1. 延长收样时间可能是一个方向 有些siRNA或shRNA介导的敲低效果在48小时甚至72小时后才会明显，因为： mRNA的半衰期可能较长； 敲低并不等于马上降解已有的mRNA； 目标蛋白的表达也可能滞后。 建议： 设 …

shRNA转染后，进行RT-PCR的最佳时间取决于多种因素，包括细胞类型、转染效率、shRNA的表达和目标基因的降解速度。一般来说，在转染后的24到72小时内进行RT-PCR是比较常见的时间点。具体来说： 24小时后：在这个时间点，可以开始检测到shRNA的表达以及目标基因的初步下调情况。对于一些高效的shRNA，这个时间点可能已经有显著的基因沉默效果。 4 …

1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA，推荐用玻璃纤维结合，洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸，小的寡核苷酸，蛋白和盐离子。注意：化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化（即PAGE胶纯化）。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在，如皮肤，头发，所有徒手接触过 …

为保证RNA转染的高效率，在转染过程中应注意： 1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA，推荐用玻璃纤维结合，洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸，小的寡核苷酸，蛋白和盐离子。注意：化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化（即PAGE胶纯化）。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境 …

umonji域包含6（JMJD6）是JumonjiC结构域蛋白家族的一个成员。相比于其他的家庭成员，JMJD6细胞活性仍不明确，其生物学功能仍然是很大的未开发。现分享一篇文献，文献中我报道JMJD6与肿瘤抑制基因p53相关，文献中用RNA转染（Entranster）研究JMJD6和p53及结肠癌发生之间的关系，以供参考。

雷公藤红素，是从传统中药雷公藤中提取的一种三萜类化合物，具有抗炎、抑制肿瘤血管生成、抑制肿瘤生长、诱导细胞凋亡以及对人类神经退行性疾病的细胞保护作用等多种作用。然而，这些功能的基础机制并不清楚。现分享一篇RNA转染（Entranster）与雷公藤红素增强肿瘤细胞中缺氧诱导因子-1活性研究的文献，以供参考。

siRNA导入细胞有以下几种方法：化学转染技术、电穿孔法、磷酸钙共沉淀技术、显微注射和载体导入技术。选择时应该依据实验条件考虑以下因素：细胞对转入方式的承受能力、细胞对病毒侵染的易感性、细胞的生长特性等。对贴壁细胞来说化学转染技术（Entranster）是最为常用的方法，而对悬浮细胞则采用电穿孔法效果较好。  

测序正确是一个重要的验证步骤，但它不能完全说明shRNA构建没有问题。下面我会具体说明为什么。 测序正确说明了什么？ shRNA序列（包括发夹结构、目标序列）与设计一致： 如果你对构建后的质粒进行了Sanger测序，序列结果和你设计的shRNA完全一致，这说明你的克隆步骤（连接、转化等）是成功的。这意味着你至少在DNA水平上构建了正确的序列结构。 但这并不代 …