该实验方案是从少量( l ~ 2mL ) 细菌培养物中分离质粒DNA 。DNA 产量为l00ng~ 5μg , 这取决于质粒的拷贝数。少量的DNA 作为体外酶促反应的底物或者模板是足够的,但是,如果质粒DNA 用于测序则需要进一步纯化。 很多年以来, 碱裂解法提取质粒DNA 一直是标准的方法。如今,人们更倾向于用试剂盒提取。下列方案是早期实验的回顾。 材料 …
阅读更多 »亲和层析纯化抗体,如何减少洗脱后中和沉淀的出现?
随着亲和层析技术的发展,蛋白纯化技术相对简单,蛋白纯化技术的应用也越来越普遍,一步亲和层析即可达到90%以上的纯度。然而,蛋白纯化的过程中各个环节不容忽视。样品处理,纯化介质的选择,纯化方法的考虑,等等,虽然纯化方法简单,但是蛋白不同,采用的纯化体系也不尽相同。只要达到最终的纯化目的就是最好的纯化方法。 对于亲和层析纯化抗体,不论是蛋白A/G还是特异性抗原亲 …
阅读更多 »DNA分离前你应该知道的那些事
DNA 是相当稳定的。这也是保存和传递遗传信息所必须具备的但是不能因此而太随意,DNA的污染来源主要是其他DNA 。 DNA 分离 分离的DNA可以是基因组的也可以是染色体组外的。 研究DNA 分离试剂盒,这些试剂盒可以是针对基因组的和染色体组外的DNA、从琼脂糖凝胶中分离DNA或者从PCR产物中抽提DNA。他们利用一些结合DNA的树脂或者滤膜,通常是一些小 …
阅读更多 »新型核酸分子荧光探针——分子信标的原理及应用
分子信标(molecular beacon)是一种具有发夹结构的新型荧光标记核酸探针,具有高灵敏度、高特异型,其在聚合酶链反应(PCR)、核酸序列的分析、活细胞内核酸的动态检测、蛋白质(酶)与核酸的相互作用等方面具有广泛的应用。 分子信标的结构 分子信标的结构一般包括三个部分:环状区、信标茎干区、荧光基团和猝灭基团。荧光基团一般联接在信标分子的5 端;猝灭基 …
阅读更多 »2024年诺贝尔化学奖之计算蛋白质设计
计算蛋白质设计(Computational Protein Design)是一种利用计算机算法来设计具有特定功能和结构的蛋白质分子的方法。该领域的目标是通过计算预测蛋白质的结构与功能关系,以设计出符合特定需求的全新蛋白质或优化已有蛋白质,应用广泛于药物开发、酶工程、生物材料等领域。 计算蛋白质设计的核心步骤 确定设计目标:首先明确蛋白质设计的目标,例如设计具 …
阅读更多 »Western blot实验最常见的10个问题及解决方案
1、Western Blot原理 Westernblot的原理是蛋白质在电力场的作用下,由大到小的进行排列,利用电泳进行分离和富集。拥有抗原表位的蛋白质分子被抗体(一抗)特异性识别并与之结合。在此基础上,酶或荧光标记的二抗识别并结合一抗,通过与底物反应显色来观察目的蛋白。 Westernblot显色的方法主要有以下几种:(1)放射自显影,(2)底物化学发光E …
阅读更多 »western-blot化学发光(ECL)时,胶片上条带很浓怎么办?
可通过以下几个方面进行改进: 1. 可减少蛋白上样量; 2. 降低一抗二抗稀释度,减少抗体孵育时间; 3. 如果背景深的话,则要把发光液沥干些再压片;如果背景不深则需减少发光时间和显影时间。 4.选择合适的发光液,比如Enlight。
阅读更多 »如何制备双链siRNA?
本方案介绍如何将合成的siRNA 有义链和反义链复性形成双链siRNA, 以及利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对双链siRNA 进行分析。 试剂 丙烯酰胺: 双丙烯酰胺(19 : 1, 40%, m/V)过硫酸铵( 10%, m/V) 复性缓冲液(10 X ) 2‘ 脱保护缓冲液[100 mmol/L 乙酸,用四甲基乙二胺( TEMED) 调整pH …
阅读更多 »western-blot实验常见问题及解答
常见问题 解决对策 两块玻璃板之间灌胶,胶总是不平 玻璃没有洗干净,应该洗得很干净 过硫酸铵和TEMED加量相对较多 加完试剂后应摇匀 总是漏胶 避免玻璃边缘(与胶条接触处)破损 将两块玻璃板摆放对齐,底部处于同一平面 膜上有明显气泡 操作时将气泡完全排除 靠膜一侧的滤纸应铺平 特异性低 优化一抗 提高一抗和 …
阅读更多 »常用的蛋白水解酶抑制剂
当细胞被裂解,内容物释放时,蛋白水解酶和其他一些降解的酶也一同被释放,这时候需要在裂解的缓冲液中加入蛋白水解酶。PS: 细胞自己的蛋白水解酶也会降解细胞内的蛋白质。 抑制剂 靶向的蛋白酶 有效浓度 储存浓度 其他 抑蛋白酶肽 丝氨酸蛋白水解酶 0.1-2ug/ml 10mg/ml溶解在PBS中 避免反复冻融 EDTA 金属蛋白水解酶 0.5-2mmol/L …
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