Q1:如果慢病毒载体中没有抗性标记,只有GFP,请问还能筛选稳转的细胞传代培养吗? A1:采用流式分选是流式细胞仪的一个功能,有流式细胞仪就可以了。一般实验室对流式都有专门的人员操作,不需要自己动手。由于没有抗性,需要注意分选过程的无菌操作。 Q2:RNA干扰如果用慢病毒做稳转的细胞株,什么样的目的RNA都可以用来干扰来做稳转的细胞株吗,目的RNA所编码蛋白 …
阅读更多 »提高RNA转染效率的几点建议
1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮肤,头发,所有徒手接触过 …
阅读更多 »siRNA转染效率不佳的原因
1. siRNA与转染试剂比例不佳 由于siRNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了siRNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率和总的细胞数量就很重要,一般细 …
阅读更多 »请问siRNA转染后48h PCR已经敲低到30%以下,但是60h收蛋白,蛋白显著上调。是什么原因,如何在蛋白水平敲低呢?
对于您的问题,siRNA转染后48小时PCR显示基因表达水平已经显著降低到30%以下,但在60小时检测蛋白时,蛋白水平却出现显著上调,这种情况可能有以下原因和应对方法: 可能的原因: 蛋白降解滞后性:即使mRNA水平在48小时时已经显著下降,但蛋白的降解可能需要更长的时间。蛋白具有相对较长的半衰期,因此在mRNA水平下降之后,蛋白水平的下降会有一定的延迟。 …
阅读更多 »细胞培养该不该加抗生素?
细胞有没有正常生长,或细胞是否污染,是细胞培养的关键。虽然,顺利的时候,细胞培养起来很简单,可不顺的时候就会出现各种问题——-细胞污染啦、细胞生长缓慢啦、细胞形态看着不对劲啦、死细胞率多啦。。。。。。。。毕竟,细胞作为一种体外培养的物质,受许多外界因素的影响,培养基、血清、孵育温度,CO2浓度。。。。。。除此之外,还有一种影响因素就是 …
阅读更多 »如何优化RNA转染条件?
可从以下几方面进行优化: 1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如 …
阅读更多 »两个shRNA在转录水平和蛋白水平都有效抑制了基因表达,但是表型做出来却不一致,是为什么?
这种情况可能是由多种因素引起的,以下是一些可能的原因: 转录水平和蛋白水平的不同调控机制:虽然shRNA能够有效地降低目标基因的mRNA和蛋白表达,但有时候蛋白质的功能并不完全依赖于其表达量。有可能是基因表达抑制后,细胞通过一些补偿机制(比如其他途径的上调或活化)来恢复其功能,导致表型不一致。 shRNA的特异性和脱靶效应:shRNA可能会靶向与目标基因相似 …
阅读更多 »怎样提高细胞转染效率?
1.选择合适的转染试剂 不同细胞系转染效率通常不同,但细胞系的选择通常是根据实验的需要,因此在转染实验前应根据实验要求和细胞特性选择适合的转染试剂。每种转染试剂都会提供一些已经成功转染的细胞株列表和文献,通过这些资料可选择最适合实验设计的转染试剂。当然,最适合的是高效、低毒、方便、廉价的转染试剂。如英格恩的 …
阅读更多 »RNA转染影响因素
转染试剂 转染中要额外注意的就是转染试剂应该是确认无RNase污染的,而且也尽量避免和质粒DNA转染混用——即使试剂本身兼容DNA和RNA转染,因RNA与DNA大小不同,转染条件不同,所需的试剂也应不同,所以RNA专用的转染试剂会更好一些。比如Entranster-R4000. RNA转染时RNA的用量 RNA转染的用量必须参考RNA转染试剂说明,因为RNA …
阅读更多 »血清对于细胞转染效率有什么影响?
血清中含有大量的蛋白质,在转染过程中,带负电的蛋白质可能干扰阳离子脂质体对核酸的吸附,影响转染效率。另外,使用脂质体等转染试剂时,由于含血清转染会将血清中的蛋白带入细胞,引发细胞毒性,导致转染效率降低,故不能有血清转染。这些转染试剂要求在转染前换无血清培养基,转染后4-6h在更换成有 …
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