对每个基因设计并检测两到四个siRNA序列 为了找到潜在靶位点,扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析,去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能,siRNA应根据mRNA低二级结构的区域设计。 选择低GC含量的siRNA 纯化体外转录siRNA 在转染前要确认 …
阅读更多 »FoxO1调控机制揭示骨质疏松治疗靶点
文献标题 《FoxO1 Responses to Chronic Oxidative Stress to Participate in Age-Related Osteoporosis by Depriving β-Catenin From TCF7》 (FoxO1通过从TCF7中剥夺β-Catenin参与年龄相关性骨质疏松症的反应机制) 影响因子 期刊为 …
阅读更多 »RNA转染过程中常见问题及解决方案
RNA转染试剂Entranster-R4000使用过程中常见问题及解决方案如下:
阅读更多 »双质粒共转染哺乳动物细胞,出现其中一个质粒表达量降低,而另一个质粒表达正常的情况,原因和解决办法
可能的原因: 质粒竞争效应: 在共转染过程中,两个质粒可能在转染效率、复制能力或表达资源(如转录因子和核糖体)上竞争。一个质粒可能因此受到抑制,导致其表达量下降。 解决方法: 提高低表达质粒的比例,例如2:1或更高。 尝试使用等摩尔浓度(而非等质量浓度)的质粒来转染。 质粒质量或纯度差异: 低表达质粒可能存在降解、污染或纯化不完全的问题,从而影响其转染效率或 …
阅读更多 »siRNA转染实验的关键点
1.纯化siRNA siRNA的浓度和纯度对转染实验非常重要。为得到高纯度的siRNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致siRNA转染实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮 …
阅读更多 »慢病毒感染后,细胞不生长怎么办
慢病毒感染后,细胞不生长可能有多种原因。以下是一些常见的原因和解决方法: 病毒滴度过高: 原因:高滴度的慢病毒可能导致细胞毒性,使细胞无法正常生长。 解决方法:降低病毒的滴度,进行一系列稀释实验,找到一个既能有效转染又不影响细胞生长的滴度。 细胞状态不佳: 原因:感染前细胞的健康状态可能影响感染后的生长。 解决方法:确保细胞在最佳状态下进行感染,例如在感染前 …
阅读更多 »慢病毒转染贴壁细胞实验方法
1.提前一天细胞铺板 提前一天种植细胞,以感染时细胞融合度在50%左右为宜(悬浮细胞根据需要调整,不要采用过高的细胞密度)。 感染实验 ⑴将EnvirusTM-LV用无血清稀释液稀释(用量参见下表),充分混匀,制成增强剂稀释液。 ⑵将病毒浓缩液用无血清稀释液稀释(用量参见下表),充分混匀,制成病毒稀释液。 注:由于病毒浓度情况不同,具体病毒浓缩液用量酌情依据 …
阅读更多 »细胞转染的方法有哪些?
1. 脂质体法。中性脂质体是利用脂质膜包裹DNA,借助脂质膜将DNA导入细胞膜内。带正电的阳离子脂质体则不同,DNA并没有预先包埋在脂质体中,而是带负电的DNA自动结合到带正电的脂质体上,形成DNA-阳离子脂质体复合物,从而吸附到带负电的细胞膜表面,经过内吞被导入细胞。脂质体法始于1987年,此法的出现使得转染效率、转染的稳定性和可重复性大大提高。阳离子脂质 …
阅读更多 »电穿孔和电融合技术原理及流程
[实验原理] 当细胞置于非常高的电场中,细胞膜就变得具有通透性,能让外界的分子扩散进细胞内,这一现象称为电穿孔。运用这一技术,许多物质,包括DNA、RNA、蛋白质、药物、抗体和荧光探针都能载入细胞。作为一种基因转导方法,电穿孔已被广泛用于各种细胞类型,包括细菌、酵母、植物和动物细胞;而且,它还能作为注射方法(称为电注射),把各种外源物质引入活细胞。与其他常用 …
阅读更多 »Hela细胞转染后死亡是什么原因?
可能有多种原因: 目标蛋白对细胞有毒性,导致细胞死亡; 转染试剂以及DNA用量信息需要优化,否则对细胞具有伤害; 细胞贴壁转染之后没有正常换液。 建议: 考虑对目标蛋白进行截短构建、尝试其他细胞系统; 摸索转染试剂以及DNA用量信息,如果转染试剂毒性太大,可以考虑尝试Entranster转染试剂。 对转染后的细胞进行换液处理,如果细胞状态感觉不够理想,可以考 …
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英格恩生物技术博客 生物实验干货分享