测序正确是一个重要的验证步骤,但它不能完全说明shRNA构建没有问题。下面我会具体说明为什么。 测序正确说明了什么? shRNA序列(包括发夹结构、目标序列)与设计一致: 如果你对构建后的质粒进行了Sanger测序,序列结果和你设计的shRNA完全一致,这说明你的克隆步骤(连接、转化等)是成功的。这意味着你至少在DNA水平上构建了正确的序列结构。 但这并不代 …
阅读更多 »电转染实验时,细胞密度是多少合适?
进行电穿孔实验时.,需确定每种细胞类型的最佳细胞密度,以使电穿孔效率最大化。对于Entranster-E电转染试剂来说,在含电转试剂的终体系中,电穿孔时的细胞密度一般在1-10×106细胞/ml范围内。对于悬浮细胞,最好是接近10×106细胞/ml的高细胞密度。对于贴壁细胞,建议的细胞密度为1-5×106 …
阅读更多 »细胞转染应该什么时候加抗生素?
细胞转染分为瞬时转染和稳定转染。瞬时转染外源核酸不整合到宿主染色体中,在短时间内在基因或蛋白水平产生较高的表达,但通常只持续几天,多用于启动子和其它调控元件的分析。稳定转染是相对需要建立某些基因整合到染色体DNA的细胞系来说的,通常需要通过一些选择性标记,如来氨丙基转移酶(APH;新霉素抗性基因),潮霉素B 磷酸转移酶(HPH),胸苷激酶(TK)等反复筛选, …
阅读更多 »靶向eIF4G1根除胰腺癌研究
文献标题 Reprograming immunosuppressive microenvironment by eIF4G1 targeting to eradicate pancreatic ductal adenocarcinoma 期刊与影响因子 期刊: Cell Reports Medicine 影响因子:14.3(2024年) 英格恩(Engree …
阅读更多 »细胞转染实验为什么不能加血清?
传统的转染试剂有一定的细胞毒性,在转染过程由于提高细胞的通透性因而不能在培养基中添加抗生素。如,阳离子脂质体。带正电的脂质体与核酸带负电的磷酸基团形成复合物被细胞内吞。血清中含有大量的蛋白质,在转染过程中,带负电的蛋白质可能干扰阳离子脂质体对核酸的吸附,影响转染效率。另外,使用脂质体等转染试剂时,由于含血清转染会将血清中的蛋白带入 …
阅读更多 »siRNA转染后细胞出现死亡是什么原因?
siRNA转染后细胞死亡,原因也是多样的,如脂质体毒性,转染浓度过高,转染前的细胞状态不佳等都可能导致转染后细胞死亡的情况发生,这种情况下就需要适当优化转染条件;可以选择细胞毒性小的非脂质体类的转染试剂,如Entranster试剂,另外,如果siRNA所靶向的基因对于维持细胞生长是非常重要的,出现细胞死亡 …
阅读更多 »问:现在是将构建好的质粒电转入到自制的感受态细胞里,质粒有10000bp,是90μL感受态细胞中加3.5μ质粒。我之前有电转过6000多bp的质粒,过夜培养可以长菌的。但是这个10000bp的质粒过夜培养没有单菌落,延长培养时间后有个别单菌落,但是挑单菌落到LB中并不浑浊。这种情况我是应该调整一下电转程序还是改一下加入质粒的量呢?
以下是详细的优化建议: 优化质粒用量(首要调整): 问题: 你目前使用的是3.5µL质粒加入90µL感受态细胞。关键在于质粒的浓度(ng/µL),而不是体积。 3.5µL 对于90µL感受态细胞来说体积不小,如果质粒浓度较高,实际DNA量可能大大超过电转最优范围。 原理: 过量的DNA会导致电击时产生过多的热量和离子效应,严重降低转化效率,尤其对大质粒(&g …
阅读更多 »细胞转染效率影响因素
细胞转染效率受多种因素影响,主要因素有下面几个: 1.转染试剂 不同细胞系转染效率通常不同,但细胞系的选择通常是根据实验的需要,因此在转染实验前应根据实验要求和细胞特性选择适合的转染试剂。每种转染试剂都会提供一些已经成功转染的细胞株列表和文献,通过这些资料可选择最适合实验设计的转染试剂。当然,最适合的是高效、低毒的转染试剂,如Entranster …
阅读更多 »细胞转染实验的不同方法
1.DEAE-葡聚糖。这是早在1965年出现的转染方法。带正电的DEAE-葡聚糖或polybrene多聚体可以结合带负电的DNA分子,使得DNA复合物结合在带负电的细胞表面。通过使用DMSO或甘油获得的渗透休克,也可能是细胞内吞作用使得DNA复合体进入细胞。DEAE-葡聚糖仅限于瞬时转染,可重复性好,转染时要除掉血清。 2.磷酸钙共沉淀转染。最早在197 …
阅读更多 »细胞转染为什么不能加血清?
看过很多细胞转染的高手,在做真核细胞转染时,都是在把核酸和转染试剂的混合液加入细胞表面以前,将融合的细胞的含血清的培养液弃去,用无血清培养基清晰后再加入混合物,4-6h后再换含血清的培养基。这是为什么呢?为什么这些转染试剂要求不含血清呢? 传统的转染试剂有一定的细胞毒性,在转染过程由于提高细胞的通透性因而不能在培养基中添加抗生素。如,阳离子脂质体。带正电的脂 …
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