在AAV病毒感染实验中,TU/mL(转导单位每毫升,Transduction Unit per milliliter)和vg/mL(病毒基因组拷贝数每毫升,Viral Genome copy per milliliter)是两种常见的病毒滴度单位。它们表示的是病毒浓度的不同方面: TU/mL:代表的是真正具有转导能力的AAV颗粒的数量,也就是能够在宿主细胞中 …
阅读更多 »siRNA转染效率不理想的原因是什么?
siRNA转染效率不理想,常见的原因有:1. RNA与转染试剂比例不佳 由于RNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了RNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率和总 …
阅读更多 »细菌生长曲线的测定及其意义
细菌生长曲线,就是将少量细菌接种到一定体积的、适合的新鲜培养基中,在适宜的条件下进行培养,定时测定培养液中的菌量,以菌量的对数作纵坐标,生长时间作横坐标,绘制曲线。 一、 细菌生长曲线的测定方法 1、菌种培养:取大肠杆菌斜面菌种1支,以无菌操作挑取1环菌苔,接入肉膏 蛋白胨培养液(LB)中,静止培养12–14h,备用。 2、制备LB培养基100m …
阅读更多 »慢病毒感染,胶体金测出来很高,可感染效果很差的原因
慢病毒感染效率低,尽管用胶体金测试显示滴度很高,可能有以下几个原因: 病毒颗粒质量:虽然胶体金检测显示病毒滴度很高,但这并不意味着所有的病毒颗粒都是功能性的。有可能病毒颗粒已经失活或者结构受损,无法有效感染目标细胞。 病毒浓度与效价的差异:胶体金检测主要测量病毒颗粒的数量,但这些颗粒不一定都具有感染性。有效感染的病毒颗粒(感染性单位)可能比实际检测的数量要低 …
阅读更多 »RNA细胞转染过程注意事项
1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮肤,头发,所有徒手接触过 …
阅读更多 »细胞培养常用的抗生素有哪些?
大多数实验室使用抗生素,但是如果无菌操作技术掌握得很好,抗生素其实也不是必需的。多数抗生素在37°C 时的半衰期都很短,培养基内实际的抗生素浓度要比你以为的低。 细胞培养所用的抗生素通常以干粉形式保存,使用前用无菌水或其他溶剂将其溶解,得到的抗生素溶液可以不需要再进行过滤除菌。 细胞培养的两种标准抗生素 庆大霉素,储存液浓度5-10 mg/ml, 工作浓度为 …
阅读更多 »脂质体转染试剂细胞毒性大的原因是什么?
已有众多的文献报道,脂质体本身会参与细胞生理活动,引起基因表达的上调或下调。如参与PKC(蛋白激酶C)通路调节(Biochemistry.1992 Sep 22;31(37): 9025-30);如抑制ATP酶的活性(Biochim Biophys Acta.2008 Apr;1777(4):362-8);如与线粒体膜发生作用(J Biol Ch …
阅读更多 »在慢病毒滴度测定的倍比稀释实验中,为什么计算滴度时好像没用上复孔?
通常,在计算滴度时,我们会选取某个稀释度的特定数据(如阳性细胞数),但这个数据往往是复孔的平均值,或者用于确认某个稀释度的数据是否可靠。因此,虽然计算公式中可能未直接体现复孔的作用,但复孔实际上已经在前期数据处理中起到了关键作用。 总结:复孔的作用是提高数据的稳定性和准确性,即使计算滴度时没有直接体现,实际上已经通过平均值计算、异常值排除等方式间接影响了最终 …
阅读更多 »siRNA表达载体的构建成功要点
对每个基因设计并检测两到四个siRNA序列 为了找到潜在靶位点,扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析,去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能,siRNA应根据mRNA低二级结构的区域设计。 选择低GC含量的siRNA 纯化体外转录siRNA 在转染前要确认 …
阅读更多 »质粒DNA转染注意事项
1.启动子的选择启动子的选择对于转染基因的有效表达是非常重要的。对于转染过程本身虽然无甚影响,但是对转染结果却有着微妙的影响。2.质粒的大小和质量线性化还是超螺旋会影响转染结果:超螺旋质粒的转染效率比线性DNA高得多,特别是瞬时转染。而线性化DNA转染的整合几率高。质粒太大了转染会困难一些。毕竟,相对致密、较小的外源异物被细胞内吞的几率要大一些。如果你的质粒 …
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