shRNA转染后,进行RT-PCR的最佳时间取决于多种因素,包括细胞类型、转染效率、shRNA的表达和目标基因的降解速度。一般来说,在转染后的24到72小时内进行RT-PCR是比较常见的时间点。具体来说: 24小时后:在这个时间点,可以开始检测到shRNA的表达以及目标基因的初步下调情况。对于一些高效的shRNA,这个时间点可能已经有显著的基因沉默效果。 4 …
阅读更多 »细胞铺板密度对于siRNA转染为什么很重要?
RNA转染试剂Entranster-R4000成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率和总的细胞数量就很重要,一般细胞数量较少时转染效率高,一些试剂由于本身毒性的影响,太低的细胞数量时毒性明显,所以会要求较高的细胞密度(汇合度),顺便说一句,看一个转染试剂 …
阅读更多 »体外转录法制备dsRNA中,怎么知道mRNA的靶区域在哪
在体外转录法制备dsRNA(双链RNA)的过程中,确定mRNA的靶区域是关键的一步。以下是一些常用的方法和步骤,以帮助确定mRNA的靶区域: 1. 目标基因的选择 首先,确定你想要抑制或研究的目标基因。你需要有这个基因的完整序列信息(通常从基因数据库中获得,如NCBI)。 2. 设计siRNA或shRNA序列 设计小干扰RNA(siRNA)或小发夹RNA(s …
阅读更多 »siRNA转染效率不佳的原因
1. siRNA与转染试剂比例不佳 由于siRNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了siRNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率和总的细胞数量就很重要,一般细 …
阅读更多 »RNA转染与LncRNA LINC00511和肝癌细胞增殖和转移研究
长链非编码RNA在人肝癌(HCC)中异常表达,并与HCC的进展有关。lncRNA linc0511(linc0511)已被证实在一些肿瘤中作为肿瘤启动子。然而,作为一中新颖的LncRNA,linc00511的具体功能仍然不是很清楚。现分享一篇RNA转染(engreen)与LncRNA LINC00511和肝癌细胞增殖和转移研究的文献,旨在评估 …
阅读更多 »RNA转染与BAFF和BCMA结合诱导多发性骨髓瘤细胞存活研究
多发性骨髓瘤(MM)是一种无法治愈的血液恶性肿瘤,其特点是恶性浆细胞克隆性增殖,与大多数患者产生单克隆免疫球蛋白有关。细胞因子白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10、干扰素-α和B细胞活化因子(BAFF)在促进MM细胞生长和耐药中的作用已得到明确阐述。越来越多的证据表明BAFF影响MM细胞的生长、存活、迁移和耐药性。B细胞成熟抗原(BCM …
阅读更多 »如何优化细胞RNA转染实验条件?
可从以下几方面进行优化: 1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如 …
阅读更多 »RNA转染与人鼻病毒1B基因敲除和干扰素应答的再激活研究
人鼻病毒(HRV)是属于Picornaviridae家族肠道病毒属的单链正义RNA病毒。它在20世纪50年代首次被发现。将近60年后,已经鉴定出超过100种血清型/基因型病毒。HRVs(HV-A,-B,-C)是所有年龄组,尤其是儿童中呼吸道感染最常见的原因,但尚未开发出有效的治疗HVS的药物。现分享一篇RN …
阅读更多 »RNA转染(Entranster)与肠黏膜屏障的信号转导和细菌移位研究
肠上皮表面由一层柱状上皮细胞构成,形成一个与大多数管腔内细菌直接接触的屏障,在防止细菌易位中起着重要作用。肠上皮屏障功能在炎症性肠病(IBD)的发病机制中起着至关重要的作用,但其机制尚未完全阐明。现分享一篇RNA转染(Entranster)与肠黏膜屏障的信号转导和细菌移位研究的文献,以供参考。
阅读更多 »siRNA转染(Entranster)与成纤维细胞瘤细胞l929-a研究
L929成纤维细胞瘤细胞(l929-a)和L929纤维肉瘤细胞(l929-n)是不同的细胞系,常用于肿瘤坏死的细胞毒性因子α(TNFα)的研究,TNFa已被报道可诱导两种细胞系的坏死。然而,当比较TNFα诱导的在这两个细胞系的细胞死亡时,l929-n表现出典型的RIP3依赖性细胞坏死,在l929-a中却不是。现分享一篇运用siRNA转染(Entr …
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