对每个基因设计并检测两到四个siRNA序列 为了找到潜在靶位点,扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析,去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能,siRNA应根据mRNA低二级结构的区域设计。 选择低GC含量的siRNA 纯化体外转录siRNA 在转染前要确认 …
阅读更多 »细胞的冷冻和储存
细胞生长时的表型会发生改变或漂变,所以细胞必须计数,计数后应马上冻存。 冷冻细胞前 检查冷冻细胞所需试剂和器具是否备齐。 确认有无菌的可用于冷冻的冻存管 。 确认液氮罐里是否有冻存细胞的位置。 冷冻细胞 将培养基中的细胞培养至对数生长期。 进行活细胞计数,不要冻存死细胞比例高达20%以上的细胞。 决定冻存量,安排需要几个冻存管。 冻存细胞在融化时要稀释10 …
阅读更多 »血清对于细胞转染效率有什么影响?
血清中含有大量的蛋白质,在转染过程中,带负电的蛋白质可能干扰阳离子脂质体对核酸的吸附,影响转染效率。另外,使用脂质体等转染试剂时,由于含血清转染会将血清中的蛋白带入细胞,引发细胞毒性,导致转染效率降低,故不能有血清转染。这些转染试剂要求在转染前换无血清培养基,转染后4-6h在更换成有 …
阅读更多 »怎么样做好siRNA细胞转染实验?
1.纯化siRNA siRNA的浓度和纯度对转染实验非常重要。为得到高纯度的siRNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致siRNA转染实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮 …
阅读更多 »使用血清时要注意哪些参数?
血清可以提供细胞生长所必需的生长因子和营养元素,某些细胞特别是转化后的细胞,对于血清的需要量是很低的,在0.5 %左右。有些细胞被“培养成“只生存在低血清浓度的培养基中。由于细胞生长所需的物质已经被完全定性,所以更多的细胞是被培养在添加有特定物质的基础培养基中。如果细胞能够生存在不添加血清的培养基中则是一种比较幸运的情况。 使用血清的时候有一些参数要注意: …
阅读更多 »大肠杆菌电转后,4度涂抹到培养基板子上会导致死亡吗?细菌电转后是不是比细胞还脆弱啊?
这个问题问得很实际,也很关键,特别是在做质粒转化实验的时候容易遇到。 回答一:大肠杆菌电转后,4℃下操作是否会导致死亡? 不会直接导致大面积死亡,但确实会影响转化效率。 电转后的大肠杆菌处于一种“受伤”的状态,细胞膜被电击短暂打破,虽然迅速恢复,但暂时很脆弱。 如果在电转后没有及时给予复苏(比如在SOC、LB等液体培养基中摇床复苏30–60分钟),就直接在低 …
阅读更多 »磷酸钙转染法实验原理及步骤
【实 验 原 理】 磷酸钙沉淀法是基于磷酸钙-DNA复合物的一种将DNA导入真核细胞的转染方法。磷酸钙有利于促进外源DNA与靶细胞表面的结合。磷酸钙-DNA复合物粘附到细胞膜并通过胞饮作用进入靶细胞,被转染的DNA可以在细胞内进行瞬时表达,也可整合到靶细胞的染色体上从而产生不同基因型和表型的稳定克隆。该方法可广泛用于转染许多不同类型的细胞。 【仪器、材料和试 …
阅读更多 »细胞转染应该什么时候加抗生素?
细胞转染分为瞬时转染和稳定转染。瞬时转染外源核酸不整合到宿主染色体中,在短时间内在基因或蛋白水平产生较高的表达,但通常只持续几天,多用于启动子和其它调控元件的分析。稳定转染是相对需要建立某些基因整合到染色体DNA的细胞系来说的,通常需要通过一些选择性标记,如来氨丙基转移酶(APH;新霉素抗性基因),潮霉素B 磷酸转移酶(HPH),胸苷激酶(TK)等反复筛选, …
阅读更多 »细胞转染实验影响因素
转染效率受多种因素影响,主要因素有下面几个: 1.转染试剂 不同细胞系转染效率通常不同,但细胞系的选择通常是根据实验的需要,因此在转染实验前应根据实验要求和细胞特性选择适合的转染试剂。每种转染试剂都会提供一些已经成功转染的细胞株列表和文献,通过这些资料可选择最适合实验设计的转染试剂。当然,最适合的是高效、低毒、方便、廉价的转染试剂。 2.细胞状态 一般低的细 …
阅读更多 »做慢病毒滴度测定实验,请问是所有的都用293t细胞来做,还是说我要在别的细胞上做稳转株,我用别的细胞去摸病毒滴度就可以呀?
核心原则 标准物理滴度测定:强烈推荐使用293T细胞。 功能性滴度测定/特定应用验证:使用你的目标细胞。 详细解释 为什么推荐293T细胞测定物理滴度? 高易感性: 293T细胞对慢病毒感染非常敏感,因为它们高表达慢病毒进入所需的受体(如LDL受体)。 高转导效率: 它们通常能达到非常高的转导效率(>80%甚至90%+),这使得检测阳性细胞、计算滴度变 …
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