悬浮细胞的siRNA转染操作步骤,以24孔板siRNA转染为例 1.提前1天细胞种植 悬浮细胞:采用对数生长期的细胞,数量为常规培养细胞数的1/3进行转染实验。如某细胞常规培养的细胞数是6×105,那么就用2×105的细胞进行转染。 2.转染过程 ⑴取0.67ug(50pmol)的siRNA,加入一定量无血清稀释液,充分混匀,制成RNA稀释液,终体积为25μ …
阅读更多 »转染实验常见问题解答
siRNA细胞转染常见问题及解答
问:siRNA导入细胞有哪些方法,哪种最好? 答:siRNA导入细胞有以下几种方法:化学转染技术、电穿孔法、磷酸钙共沉淀技术、显微注射和载体导入技术。选择时应该依据实验条件考虑以下因素:细胞对转入方式的承受能力、细胞对病毒侵染的易感性、细胞的生长特性等。对贴壁细胞来说化学转染技术是最为常用的方法,而对悬浮细胞则采用电穿孔法效果较好。 问:哪种转染试剂效果好? …
阅读更多 »siRNA转染很有效(蛋白水平明显降低),将siRNA序列构建进慢病毒(shRNA形式)后感染细胞,荧光表达很强,但目标蛋白并未敲低,这是什么原因
你遇到的这个问题在慢病毒(lentivirus)介导的RNA干扰实验中其实挺常见,下面我们逐步分析下可能的原因: 实验现象简述: siRNA转染敲得很有效(蛋白水平明显降低); **将siRNA序列构建进慢病毒(shRNA形式)**后感染细胞; 荧光表达很强(说明病毒成功进入细胞,且有表达); 但目标蛋白并未敲低,几乎没有 knockdown 效果。 可能原 …
阅读更多 »对于难转染的细胞,如何提高其转染效率?
对于难转染的细胞的转染,如何提高转染效率的问题也是目前研究的技术难题。一般建议使用电转的方法,但是由于电转的方法对细胞损伤比较大,该方法也未必是最佳的。推荐Entranster-E电转染试剂,可将电击对细胞的损伤降到最低。转染效率的确定,常用的是流式细胞仪检测的方法。
阅读更多 »成功转染siRNA的主要关键点有什么?
1.设计合成有效的siRNA RNAi的核心需要siRNA对相应mRNA进行有效的结合和作用。siRNA的设计合成首先很重要,最优的设计可以用最小的工作浓度取得满意的沉默效果,减少副反应的发生。siRNA的设计可以通过检索,优先选用经过验证的siRNA或设计多对siRNA。需要强调的是,需要同时设置阴性对照以排除非特异沉默现象和阳性对照以确认整个实验体系的有 …
阅读更多 »细胞转染效率的影响因素
1.细胞密度 一般来说,当细胞密度达到60%~80%时进行转染可以取得较高的转染效率,过低或过高都会影响转染效果。 2.细胞状态 这点非常关键,很多时候传代次数太少或者太多都将导致细胞对转染试剂敏感度的改变。因此,为了提高转染效率以及转染稳定性、降低细胞毒性,应尽量使用适度传代的细胞系,并在不同次实验时保持细胞传代次数的一致性。 还有,尽量选择无 …
阅读更多 »请问siRNA转染后48h PCR已经敲低到30%以下,但是60h收蛋白,蛋白显著上调。是什么原因,如何在蛋白水平敲低呢?
对于您的问题,siRNA转染后48小时PCR显示基因表达水平已经显著降低到30%以下,但在60小时检测蛋白时,蛋白水平却出现显著上调,这种情况可能有以下原因和应对方法: 可能的原因: 蛋白降解滞后性:即使mRNA水平在48小时时已经显著下降,但蛋白的降解可能需要更长的时间。蛋白具有相对较长的半衰期,因此在mRNA水平下降之后,蛋白水平的下降会有一定的延迟。 …
阅读更多 »转染荧光效果良好,但是24小时qpcr没有敲低,是要延长收样时间吗?
这是个很实际的问题。在转染实验中,荧光标记良好说明转染效率高,但如果qPCR在24小时没有观察到预期的基因敲低效果,可能存在以下几种情况: 1. 延长收样时间可能是一个方向 有些siRNA或shRNA介导的敲低效果在48小时甚至72小时后才会明显,因为: mRNA的半衰期可能较长; 敲低并不等于马上降解已有的mRNA; 目标蛋白的表达也可能滞后。 建议: 设 …
阅读更多 »RNA细胞转染实验注意事项
进行RNA细胞转染实验时,应注意以下几点: 1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中R …
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