质粒DNA提取的方法很多,有碱变性法、羟基磷灰石柱层析法、溴化乙锭 – 氯化铯梯度超离心法等。本次实验是一种小量快速提取法。小量快速提取法也有多种,但基本原理和步骤是一致的.包括以下步骤:(1)裂解菌体细胞;(2)质粒和染色体DNA的分离;(3)除去蛋白质。RNA及其他影响限制性酶活性的细胞成分;(4)除去提取过程中使用的去垢剂、盐等。 一、原理 …
阅读更多 »怎样做好荧光原位杂交实验(FISH)?
实验方法及步骤 探针变性 将探针在75℃恒温水浴中温育5 min,立即置0℃,5~10 min,使双链DNA探针变性。 标本变性 将制备好的染色体玻片标本于50℃培养箱中烤片2~3 h。(经Giemsa染色的标本需预先在固定液中退色后再烤片)。 取出玻片标本,将其浸在70~75℃的体积分数70% 甲酰胺/2×SSC的变性液中变性2~3 min。 立即按顺序将 …
阅读更多 »慢病毒感染后,未能实现相关敲降的原因是什么?
慢病毒感染后未能实现敲降的原因可能有多种。以下是一些可能的原因及其解释: 慢病毒包装质量问题: 病毒滴度较低,导致感染效率不高,可能无法有效转导目标细胞。 病毒颗粒中没有足够的有效载体,影响敲降效果。 靶向序列设计问题: shRNA或sgRNA设计不合理,没有有效靶向目标基因的序列。 目标序列与基因组其他部位的相似性导致脱靶效应,影响敲降效果。 感染条件不佳 …
阅读更多 »降落PCR实验原理及步骤
降落PCR(touchdown PCR),一种PCR技术,主要用于PCR的条件的优化。在许多情况下引物的设计使得PCR难以进行,例如特异性不够易错配等。退火温度过高会使PCR效率过低,但退火温度过低则会使非特异扩增过多。 实验材料: 基因样品 仪器、耗材: PCR仪 实验步骤: 1、反应体积为50 μl。 2、人CD137胞膜外区基因的PCR扩增体系:CD1 …
阅读更多 »什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?
凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。 通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一 …
阅读更多 »如何提高qPCR反应的灵敏度与特异性?
1. 首先确定模板RNA完整性好,无DNA污染。 2. RNA模板中不应含有扩增反应抑制剂。 3. 为了防止模板降解,在反应体系中加入RNase抑制剂RNasin。 4. 使用适量的模板RNA,模板量太多会降低特异性,太少会导致扩增不出条带或条带太弱。 5. 若模板中有二级结构,可通过提高逆转录反应温度来提高扩增效果。 6. 设计引物时,避免在引物3’端含有 …
阅读更多 »启动子甲基化调控的miR-148a-3p通过靶向MAP3K9抑制肺腺癌的进展
非小细胞肺癌(NSCLC)占各种肺癌的85%。肺腺癌(LUAD)是NSCLC的主要亚型,其特点是高转移和高死亡率。NSCLC患者的低生存率主要是由于远处转移,占癌症相关死亡的90%。尽管许多治疗策略已经得到应用,但NSCLC的预后仍令人不太满意。缺乏适当的生物标志物和准确的治疗目标以及化疗药物的毒性导致了肺癌的疗效不佳。因此,探索LUAD发生和发展的分子机制 …
阅读更多 »DNA 凝胶电泳注意事项
DNA胶用来分离、确定或者纯化DNA片段。用于DNA测序反应的测序胶不在这儿讨论。每位实验室成员有不同的制胶方法。 样品准备 6 X 上样缓冲液: 30% (V/V) 甘油, 0.25%(W/V) 溴酚蓝, 0.25% (W/V) 二甲苯腈蓝,蒸馏水配制。贮于-20’C 。 样品缓冲液与DNA在60’C 温育5 分钟。 标准分子/分子 …
阅读更多 »重叠延伸PCR实验
重叠延伸PCR实验 重叠延伸PCR技术(gene splicing by overlap extension PCR,简称SOEPCR)由于采用具有互补末端的引物,使PCR产物形成了重叠链,从而在随后的扩增反应中通过重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼接起来。 实验方法原理: 此技术利用PCR技术能够在体外进行有效的基因重组,而且不需要内切酶消化和连接酶 …
阅读更多 »离心的种类和原理
离心方法主要有两种:制备型(用来分离某些颗粒)和分析型(用来了解分离颗粒的物理性质)。 分子或细胞生物学实验室中所作的决大多数离心机属于制备型离心机,而多数常规制备型离心是差速离心。 g 力和每分钟旋转次数(rpm) 是大略的值:取决于所用的离心机型号和转子。 差速离心(沉淀) 原理:样品在一定速度下离心,分成上清部分与沉淀部分。样品根据沉降速度不同得到分离 …
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英格恩生物技术博客 生物实验干货分享