在基因转染实验中,共转染的两种质粒通常不一定需要选择不同的载体,但有一些情况下选择不同的载体可能会更有优势: 同源重组和重复序列问题:如果两个质粒使用相同的载体序列,可能会发生同源重组,导致质粒结构不稳定,尤其是在细菌扩增和分离时。这种情况下,选择不同载体可以降低同源重组的风险。 抗性筛选:如果需要通过抗生素筛选两种质粒,最好选择含有不同抗性基因的载体,以便 …
阅读更多 »慢病毒感染贴壁细胞实验方法
1.提前一天细胞铺板 提前一天种植细胞,以感染时细胞融合度在50%左右为宜(悬浮细胞根据需要调整,不要采用过高的细胞密度)。 感染实验 ⑴将EnvirusTM-LV用无血清稀释液稀释(用量参见下表),充分混匀,制成增强剂稀释液。 ⑵将病毒浓缩液用无血清稀释液稀释(用量参见下表),充分混匀,制成病毒稀释液。 注:由于病毒浓度情况不同,具体病毒浓缩液用量酌情依据 …
阅读更多 »细胞转染实验的建议
1.如为贴壁生长细胞,一般要求在转染前一日,必须应用胰酶处理成单细胞悬液,重新接种于培养皿或瓶,转染当日的细胞密度以70-90%(贴壁细胞)或2×10^6-4×10^6细胞/ml(悬浮细胞)为宜,最好在转染前4h换一次新鲜培养液。 2.用于转染的质粒DNA必须无蛋白质,无RNA和其他化学物质的污染,OD260/280比值应在1.8以上。 3.培养基中的血清 …
阅读更多 »成功转染siRNA的主要关键点有什么?
1.设计合成有效的siRNA RNAi的核心需要siRNA对相应mRNA进行有效的结合和作用。siRNA的设计合成首先很重要,最优的设计可以用最小的工作浓度取得满意的沉默效果,减少副反应的发生。siRNA的设计可以通过检索,优先选用经过验证的siRNA或设计多对siRNA。需要强调的是,需要同时设置阴性对照以排除非特异沉默现象和阳性对照以确认整个实验体系的有 …
阅读更多 »siRNA转染实验的关键点
1.纯化siRNA siRNA的浓度和纯度对转染实验非常重要。为得到高纯度的siRNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致siRNA转染实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮 …
阅读更多 »细胞转染实验的方法都有什么?
1. 电穿孔法。通过短暂的高电场电脉冲处理细胞,沿细胞膜的电压差异会导致细胞膜的暂时穿孔。DN被认为是穿过孔扩散到细胞内的。电脉冲和场强的优化对于成功的转染非常重要,因为过高的场强和过长的电脉冲时间会不可逆地伤害细胞膜而裂解细胞。理论上说电穿孔法可用于各种细胞,且不需要另外采购特殊试剂,但需要昂贵的电转仪。此法每次转染需要更多的细胞和DNA,因为细胞的死亡率 …
阅读更多 »已经把miRNA转染到了SW480细胞中,用来抑制RUNX1的表达,从而抑制细胞行为。已经通过WB验证了转染三天后RUNX1受到了抑制。现在的问题是应该在转染三天后消化细胞再做划痕实验,还是先种板做划痕再进行转染。
我的建议: 通常来说,如果你想研究miRNA对划痕愈合(细胞迁移)的影响,建议先进行miRNA转染,等待足够的时间让miRNA发挥作用(你提到的是三天),然后再进行划痕实验。这可以确保在进行划痕实验时,RUNX1已经被下调,迁移实验所观察到的结果是由RUNX1抑制所导致的。 但如果你担心转染后细胞的粘附性不好或者转染效率不高,也可以先进行划痕实验,让细胞在板 …
阅读更多 »siRNA转染效率低的原因有哪些?
1. RNA与转染试剂比例不佳 由于RNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了RNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这 …
阅读更多 »在慢病毒滴度测定的倍比稀释实验中,为什么计算滴度时好像没用上复孔?
通常,在计算滴度时,我们会选取某个稀释度的特定数据(如阳性细胞数),但这个数据往往是复孔的平均值,或者用于确认某个稀释度的数据是否可靠。因此,虽然计算公式中可能未直接体现复孔的作用,但复孔实际上已经在前期数据处理中起到了关键作用。 总结:复孔的作用是提高数据的稳定性和准确性,即使计算滴度时没有直接体现,实际上已经通过平均值计算、异常值排除等方式间接影响了最终 …
阅读更多 »请问siRNA转染后48h PCR已经敲低到30%以下,但是60h收蛋白,蛋白显著上调。是什么原因,如何在蛋白水平敲低呢?
对于您的问题,siRNA转染后48小时PCR显示基因表达水平已经显著降低到30%以下,但在60小时检测蛋白时,蛋白水平却出现显著上调,这种情况可能有以下原因和应对方法: 可能的原因: 蛋白降解滞后性:即使mRNA水平在48小时时已经显著下降,但蛋白的降解可能需要更长的时间。蛋白具有相对较长的半衰期,因此在mRNA水平下降之后,蛋白水平的下降会有一定的延迟。 …
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