细胞转染分为瞬时转染和稳定转染。瞬时转染外源核酸不整合到宿主染色体中,在短时间内在基因或蛋白水平产生较高的表达,但通常只持续几天,多用于启动子和其它调控元件的分析。稳定转染是相对需要建立某些基因整合到染色体DNA的细胞系来说的,通常需要通过一些选择性标记,如来氨丙基转移酶(APH;新霉素抗性基因),潮霉素B 磷酸转移酶(HPH),胸苷激酶(TK)等反复筛选, …
阅读更多 »悬浮细胞的siRNA转染实验步骤
悬浮细胞的siRNA转染操作步骤,以24孔板siRNA转染为例 1.提前1天细胞种植 悬浮细胞:采用对数生长期的细胞,数量为常规培养细胞数的1/3进行转染实验。如某细胞常规培养的细胞数是6×105,那么就用2×105的细胞进行转染。 2.转染过程 ⑴取0.67ug(50pmol)的siRNA,加入一定量无血清稀释液,充分混匀,制成RNA稀释液,终体积为25μ …
阅读更多 »测序正确是不是说明shRNA构建没有问题
测序正确是一个重要的验证步骤,但它不能完全说明shRNA构建没有问题。下面我会具体说明为什么。 测序正确说明了什么? shRNA序列(包括发夹结构、目标序列)与设计一致: 如果你对构建后的质粒进行了Sanger测序,序列结果和你设计的shRNA完全一致,这说明你的克隆步骤(连接、转化等)是成功的。这意味着你至少在DNA水平上构建了正确的序列结构。 但这并不代 …
阅读更多 »细胞转染实验易出现的问题
1.准备不足 做细胞转染的时候,在开展正式实验前要多做预试验,优化转染条件。优化转染条件包括:转染试剂的用量、DNA密度、细胞密度、试剂和DNA混合孵育时间等等。 2.细胞污染 细胞污染也是造成细胞死亡,转染效率低下的一大原因。首先,转染细胞用的质粒必须保证无菌。而现在市场上的一般的质粒提取试剂盒都做不到绝对无菌。分享一个小秘诀:将提完质粒后或者提的最后一步 …
阅读更多 »siRNA转染效率不理想的原因是什么?
siRNA转染效率不理想,常见的原因有:1. RNA与转染试剂比例不佳 由于RNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了RNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率和总 …
阅读更多 »转染方法的选择取决于哪些因素?
转染方法:将基因导入真核细胞的方法可分为三类:生化方法转染、物理方法转染、病毒介导的转导。 转染方法的选择取决于下列几个实验要素: .最终目的是基因表达还是蛋白质生产 .采用的细胞类型(贴壁细胞或悬浮细胞,适应培养的细胞或原代细胞) .细胞系抵抗转染压力的能力 .采用的筛选方法的类型 .培养条件 .转染的核酸种类( DNA 、RNA 、siRNA 或寡核菩酸 …
阅读更多 »如何选择慢病毒和腺病毒系统?
慢病毒载体系统和腺病毒载体系统比较 病毒表达系统 慢病毒表达系统(Lentivirus) 腺病毒表达系统(Adenovirus) 病毒基因组 RNA病毒 双链DNA病毒 复制 自主复制 自主复制 是否整合 病毒基因组整合于宿主基因组,长时间、稳定表达外源基因 病毒基因组游离于宿主基因组外,瞬时表达外源基因 感染细胞类型 感染分裂和不分裂细胞,适用于难转染的原 …
阅读更多 »请问瞬时转染的效率如何确定?荧光镜下看感觉无法量化和保证每个组别的转染效率完全一致
这是一个很重要也很实际的问题——瞬时转染效率是RNA干扰或质粒表达实验中一个关键变量,但很多人低估了它对结果的影响。 问题核心: 你说得非常对: “荧光镜下看感觉无法量化和保证每个组别的转染效率完全一致。” 用荧光镜看确实是定性评估,不够准确,且不同组别(尤其不同处理条件)可能转染效率不同,导致后续敲低效率、蛋白表达等结果不具可比性。 几种常见的转染效率评估 …
阅读更多 »机器学习识别氧化磷酸化特征用于卵巢癌预后和个体化治疗
文章标题 《基于机器学习的氧化磷酸化特征识别在卵巢癌预后、免疫浸润和药物敏感性中的应用》 英文标题:Machine learning-based identification of an oxidative phosphorylation signature for prognosis, immune infiltration, and drug sensi …
阅读更多 »为什么我的细胞转染效率低?
1)优化条件:质粒不同,所转染的细胞不同及定量的准确性等因素会导致在一些情况下所做的转染不在该优化条件内。这种情况下需要对质粒转染试剂的配比进行优化。另外,可选用更合适的转染试剂,如Entranster试剂。 2)抑制剂:不要在用于制备DNA-转染试剂复合物的培养基中使用抗生素,EDTA,柠檬酸盐,磷酸盐,RPMI,硫酸软骨素,透明质酸,硫酸葡聚糖或其他硫酸 …
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