英格恩生物技术博客 生物实验干货分享
计算蛋白质设计（Computational Protein Design）是一种利用计算机算法来设计具有特定功能和结构的蛋白质分子的方法。该领域的目标是通过计算预测蛋白质的结构与功能关系，以设计出符合特定需求的全新蛋白质或优化已有蛋白质，应用广泛于药物开发、酶工程、生物材料等领域。 计算蛋白质设计的核心步骤 确定设计目标：首先明确蛋白质设计的目标，例如设计具 …
阅读更多 »大脑与心脏连接的开端——甚至早于脊椎动物的进化起源
过去的 15 年中，科学家们探索了心脏和大脑之间的发展联系。例如，在 2010 年，研究人员发现，小鼠胚胎中分裂和分化形成心脏的细胞与喉咙和下头的肌肉细胞来自同一个细胞池，两者的关键部件的来源是有同一处。 心头连接的开端—— 海鞘? 实际上，胚胎的头心连接早于脊椎动物的进化起源，甚至可能早于头本身。研究人员在研究海鞘时偶然发现了这种联系，这种海鞘是一种水滴状 …
阅读更多 »为什么国产mRNA疫苗的研发如此艰难？
新冠爆发以来，mRNA疫苗的研发一直都受群众热议，尤其是Delta变异株的出现，让大家更是期盼国产mRNA疫苗早日上市。而从疫情爆发到现在接近两年，直到最近才有即将上市的消息传出，为什么国产mRNA疫苗的研发如此艰难呢？ 实际上，mRNA疫苗的研发主要包含两个核心技术：1.抗原的设计2.递送系统的设计。相对于抗原设计来说，递送系统更是难以突破的关键。 mRN …
阅读更多 »人类学家 Herman Pontzer , 打破人类关于卡路里燃烧的认知
近来，科学家Pontzer系统地测量了各种动物和各行各业的人每天使用的总能量，得出了非常令人惊讶的结果：平均而言，锻炼并不能帮助人们燃烧更多的能量；非洲活跃的狩猎采集者每天消耗的能量并不比办公室久坐不动的工作人员多；孕妇每天燃烧的卡路里并不比其他成年人多。 在 2000 年初期，我们对人类的总能量消耗 (TEE) 知之甚少——即一个人的37 万亿个细胞在 2 …
阅读更多 »2024诺贝尔化学奖得主David Baker和他的Rosetta模型
Rosetta模型是一套用于蛋白质结构预测、分子对接和设计的计算工具集，由2024年诺贝尔化学奖得主，华盛顿大学David Baker教授的实验室开发。Rosetta最初被设计用于蛋白质结构预测，但如今已发展成一套多功能的平台，被广泛应用于蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质和蛋白质-小分子相互作用、以及新蛋白质设计等领域。 Rosetta模型的核心功能 1.蛋白质 …
阅读更多 »2022的七大热点技术： 靶向基因治疗、空间多组学……
1.完全基因组 在去年5月发表的预印本中，人类共有基因组序列 GRCh38 添加了近 2 亿个新碱基对，并撰写了人类基因组的最后一章。 GRCh38 于 2013 年首次发布，一直是一个有价值的工具，但也存在漏洞。主要是因为测序技术产生的读数准确但较短。它们的长度不足以明确地绘制出高度重复的基因组序列，包括覆盖染色体末端的端粒和在细胞分裂过程中协调新复制的 …
阅读更多 »Nature | 癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变
《Nature》最新报道了癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变。突变情况由许多过程塑造，基因区域易受突变影响，但同时受到转录偶联修复的保护。在微生物中，转录诱变产生影响，但在高等真核生物中的影响仍有待确定。ID4 -a，指的是转录相关的诱变导致一种癌症相关的插入 – 缺失 突变特征，发生短片段（2 到 5 个碱基对）的缺失 。哺乳动物中的缺陷 …
阅读更多 »为什么RNA疗法的研究很多，药物却很少？
mRNA疫苗的成功上市，让RNA疗法的研究再次成为科研界的焦点。 一直以来，小干扰RNA（siRNA）都是RNA研究的热点，它能够在多个水平实现基因的表达沉默，靶向治疗多种疾病。其实，除了基因沉默，还有可以激活目标基因表达的RNA技术，也就是RNA激活（RNAa），具有这种功能的RNA被称为小激活RNA（saRNA）。对于肿瘤免疫、代谢疾病来说，将saRNA …
阅读更多 »甜味使我们获得能量，苦味提醒我们潜在的毒性，酸味其实是……
原来动物也能尝到酸味 咬一口柠檬，你可能会体验到一种强烈的感觉：直击大脑的刺激、令人垂涎的酸味和令人愉悦的气味。作为五种主要口味之一的酸味在生活中十分常见（酸味、甜味、咸味、咸味和苦味）——但科学家们对酸味是如何演变的知之甚少。最近发表在英国皇家学会学报的一篇论文，探讨了酸味的起源与作用。 很多物种在进化过程中失去了大多口味。比如海豚除了咸味之外，似乎没有任 …
阅读更多 »拯救了全球猪产业的冠状病毒变种历史，是否可以重现？
早在1946年——普渡大学的兽医研究人员发现，一种可怕的病毒入侵幼猪内脏的东西会导致幼猪腹泻、呕吐和体重减轻，最终导致大多数猪死亡。当时科学家们并不知道这种疾病的原因，这种疾病摧毁了美国的养猪场，事实证明，这种养猪户的噩梦是一种冠状病毒，被命名为传染性胃肠炎病毒 (TGEV)。 1970 年代，TGEV在世界范围内传播，过程中发生了一个奇怪的转变：TGEV出 …
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