回答:“无抗的都长满”,说明细胞活性和数量没问题,基本排除培养条件问题。那么核心矛盾集中在质粒是否成功进入细胞并表达抗性基因。这里有几个关键排查点:质粒浓度是否足够(建议>100ng/μL)、抗性基因是否匹配(如氨苄不能用于表达AmpR的质粒)、抗性板浓度是否正确(过高会杀死阳性克隆)。 特别注意的是检查质粒纯度。实验室常用乙醇沉淀法提质粒,但残留的盐 …
阅读更多 »做好RNA转染的几点建议
1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮肤,头发,所有徒手接触过 …
阅读更多 »如何构建siRNA表达载体?
siRNA表达载体构建可以:(1)作为后基因组时代基因功能分析的有力工具;(2)应用于基因组学、细胞信号传导通路分析;(3)用于药物靶点筛选、疾病治疗。 实验方法原理: 多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(shorthairpinRNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动 …
阅读更多 »siRNA转染后细胞出现死亡是什么原因?
siRNA转染后细胞死亡,原因也是多样的,如脂质体毒性,转染浓度过高,转染前的细胞状态不佳等都可能导致转染后细胞死亡的情况发生,这种情况下就需要适当优化转染条件;可以选择细胞毒性小的非脂质体类的转染试剂,如Entranster试剂,另外,如果siRNA所靶向的基因对于维持细胞生长是非常重要的,出现细胞死亡 …
阅读更多 »电转染实验时,siRNA有什么要求?
使用高纯度、无菌的siRNA。确定电转染的最佳siRNA浓度。建议在250-750nM最终浓度范围内的进行siRNA不同浓度的梯度实验。建议设置一个非靶向或无意义的siRNA对照序列,以验证实验siRNA的特异性。同时也验证,针对单个基因用多个siRNA序列实验产生的表型是否是由于脱靶 …
阅读更多 »请问蛋白半衰期30小时,siRNA转染后大约多久收样合适呢?
既然目标蛋白的半衰期是30小时,说明它在细胞中相对稳定,也就是说,蛋白不会很快降解。 在使用siRNA干扰该蛋白的表达时,有几个关键时间点需要考虑: 一般siRNA作用流程: 转染后6–12小时:siRNA开始被细胞利用,mRNA水平开始下降。 24–48小时:mRNA水平通常显著降低(具体情况因靶基因和细胞类型而异)。 48–72小时:蛋白水平逐步下降,尤 …
阅读更多 »siRNA转染后目标基因不降反升的原因
一、生物学与分子机制相关原因 1️⃣ 负反馈调控 (feedback regulation) 某些基因被抑制后,会触发细胞的代偿机制。 例如,目标基因下调后,上游转录因子或信号通路被激活,从而 反向上调目标基因 的转录。 特别常见于信号通路核心分子(如 MAPK、PI3K、NF-κB、p53 等)的 knockdown 实验。 建 …
阅读更多 »细胞电转染效率不高的原因是什么?
细胞电转染效率不高,有可能是以下原因造成的: 1. 不合适的电场强度 合适的电场强度对于电转染实验非常重要,电场强度不能过高,过高会增加细胞的死亡率;也不能过低,过低不能增加膜的通透性或在膜上形成小孔。不同细胞系具有不同的最佳场强值,实验前应测定所转染细胞系的最佳电场强度。 2. 细胞选择错误 用于电转的细胞一般选取处于对数生长期的细胞(15代以内,传代后2 …
阅读更多 »质粒DNA转染注意事项
1.启动子的选择启动子的选择对于转染基因的有效表达是非常重要的。对于转染过程本身虽然无甚影响,但是对转染结果却有着微妙的影响。2.质粒的大小和质量线性化还是超螺旋会影响转染结果:超螺旋质粒的转染效率比线性DNA高得多,特别是瞬时转染。而线性化DNA转染的整合几率高。质粒太大了转染会困难一些。毕竟,相对致密、较小的外源异物被细胞内吞的几率要大一些。如果你的质粒 …
阅读更多 »慢病毒感染,胶体金测出来很高,可感染效果很差的原因
慢病毒感染效率低,尽管用胶体金测试显示滴度很高,可能有以下几个原因: 病毒颗粒质量:虽然胶体金检测显示病毒滴度很高,但这并不意味着所有的病毒颗粒都是功能性的。有可能病毒颗粒已经失活或者结构受损,无法有效感染目标细胞。 病毒浓度与效价的差异:胶体金检测主要测量病毒颗粒的数量,但这些颗粒不一定都具有感染性。有效感染的病毒颗粒(感染性单位)可能比实际检测的数量要低 …
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