1)优化条件:质粒不同,所转染的细胞不同及定量的准确性等因素会导致在一些情况下所做的转染不在该优化条件内。这种情况下需要对质粒转染试剂的配比进行优化。另外,可选用更合适的转染试剂,如Entranster试剂。 2)抑制剂:不要在用于制备DNA-转染试剂复合物的培养基中使用抗生素,EDTA,柠檬酸盐,磷酸盐,RPMI,硫酸软骨素,透明质酸,硫酸葡聚糖或其他硫酸 …
阅读更多 »做嘌呤霉素筛选滴定时,感染两天,puro杀3天,5天细胞长得很密原因和解决方法,另外镜下数整个孔的克隆数感觉困难,能换成镜下视野面积与孔面积比换算吗?
问题1:“感染两天,puro杀3天,5天细胞都长很密” 原因: 细胞分裂快(比如 293T)→ 在5天内即使有筛选,还是会长满。 感染率高 → 很多细胞表达抗性,嘌呤霉素筛选不够“稀释” 建议: 缩短时间:感染 24h 后就加 puromycin,第 2 天开始杀,杀 2–3 天就足够。 更稀释的病毒梯度:推荐加大稀释倍数:1:1000,1:5000,甚至 …
阅读更多 »活细胞的显微计数方法及步骤
将细胞样品与台盼蓝染料混合。活细胞排斥染料,而死细胞被染成深蓝色。将细胞铺在血球计数器的玻板上,显微镜下进行人工计数。 一、材料 血(球)计数计(改进的Neubauer 型),每次用后洗净并晾干。(也可以用其他计数器,只是格子不同。) 血(球)计数计的盖玻片(可重复使用),每次用后洗净并晾干。 含0.4% (W/V) 台盼蓝的PBS 。 计数器 悬浮好的细胞 …
阅读更多 »怎样做好siRNA细胞转染实验
1.纯化siRNA siRNA的浓度和纯度对转染实验非常重要。为得到高纯度的siRNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致siRNA转染实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮 …
阅读更多 »RNA转染(entranster)后沉默现象不明显怎么办?
可能原因: 1. RNA与转染试剂比例不佳。可进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳。 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。 3. RNA效率不高。选择最优RNA,并采用已知高效的RNA做对照。 4. RNA酶污染。建议无RNA酶和内毒素的吸头、离心管和溶液等材料和实验器具。 5. 转染后培养时间不够。在mRNA水平可以到48 小时以后验证结果,在蛋白水 …
阅读更多 »是否有嘌呤霉素筛选标记的病毒的病毒滴定protocol,看了好多好多不一样的?这个有比较权威又大众的滴度操作流程吗?
关于使用嘌呤霉素筛选标记(puromycin resistance marker)的慢病毒(lentivirus)或逆转录病毒(retrovirus)进行病毒滴定(virus titration)的 protocol,确实有不少不同的做法,这是因为不同实验室根据自己的系统和需求进行了优化。但是,有一些权威且广泛应用的标准流程可以作为通用参考,下面是整理的一个 …
阅读更多 »siRNA细胞转染操作步骤
下面以Entranster-R4000试剂为例,说一下siRNA转染步骤(24孔板) 1.提前1天细胞种植 贴壁细胞:提前一天将细胞种植在24孔板中,以转染时细胞汇合度(Confluence)在30%左右为宜,转染前全培养基总量为0.45ml。 悬浮细胞:采用对数生长期的细胞,数量为常规培养细胞数的1/3进行转染实验。如某细胞常规培养的细胞数是6×105,那 …
阅读更多 »如何优化RNA转染条件?
可从以下几方面进行优化: 1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如 …
阅读更多 »RNA细胞转染过程注意事项
1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致RNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮肤,头发,所有徒手接触过 …
阅读更多 »电转染实验过程中易出现的问题
不合适的电场强度 合适的电场强度对于电转染实验非常重要,电场强度不能过高,过高会增加细胞的死亡率;也不能过低,过低不能增加膜的通透性或在膜上形成小孔。不同细胞系具有不同的最佳场强值,实验前应测定所转染细胞系的最佳电场强度。 细胞选择错误 用于电转的细胞一般选取处于对数生长期的细胞(15代以内,传代后2d)。因为处于对数生长期的细胞分裂旺盛,表面结构致密比稳定 …
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