2026年 6 月 19日, 星期五
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2024诺贝尔化学奖得主David Baker和他的Rosetta模型

Rosetta模型是一套用于蛋白质结构预测、分子对接和设计的计算工具集,由2024年诺贝尔化学奖得主,华盛顿大学David Baker教授的实验室开发。Rosetta最初被设计用于蛋白质结构预测,但如今已发展成一套多功能的平台,被广泛应用于蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质和蛋白质-小分子相互作用、以及新蛋白质设计等领域。 Rosetta模型的核心功能  1.蛋白质 …

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拯救了全球猪产业的冠状病毒变种历史,是否可以重现?

早在1946年——普渡大学的兽医研究人员发现,一种可怕的病毒入侵幼猪内脏的东西会导致幼猪腹泻、呕吐和体重减轻,最终导致大多数猪死亡。当时科学家们并不知道这种疾病的原因,这种疾病摧毁了美国的养猪场,事实证明,这种养猪户的噩梦是一种冠状病毒,被命名为传染性胃肠炎病毒 (TGEV)。 1970 年代,TGEV在世界范围内传播,过程中发生了一个奇怪的转变:TGEV出 …

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2024诺贝尔化学奖之蛋白质结构预测

蛋白质结构预测(Protein Structure Prediction)是一项利用计算方法预测蛋白质分子的三维结构的技术。由于蛋白质的功能很大程度上依赖于其三维结构,预测其结构对理解生物过程、药物设计等领域具有重要意义。然而,实验确定蛋白质结构(如X射线晶体学、核磁共振等方法)耗时费力,因此计算预测成为重要替代方法。 蛋白质结构预测的主要方法 同源建模(H …

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2022的七大热点技术: 靶向基因治疗、空间多组学……

1.完全基因组 在去年5月发表的预印本中,人类共有基因组序列 GRCh38 添加了近 2 亿个新碱基对,并撰写了人类基因组的最后一章。 GRCh38 于 2013 年首次发布,一直是一个有价值的工具,但也存在漏洞。主要是因为测序技术产生的读数准确但较短。它们的长度不足以明确地绘制出高度重复的基因组序列,包括覆盖染色体末端的端粒和在细胞分裂过程中协调新复制的 …

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差点失去的硕士学位,被女友拯救了(二)

原创文章,转载请注明出处。 正当我兴致勃勃准备去找导师说试剂的事,舍长突然来电了。 “喂,你搁哪儿呢,快来园艺学院201,急事,特急!”还没等我说好,电话就被挂了。 这语气听起来倒是挺急的,我也不耽误,赶紧去救我舍长于水火之中。 毕竟,明早还得仰仗他给我带早饭呢。 火速蹬着自行车到了园艺楼,跨步上了楼梯,冲到201门口:“舍长,我来了!“ “快,来帮我整死这 …

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2024年诺贝尔化学奖之计算蛋白质设计

计算蛋白质设计(Computational Protein Design)是一种利用计算机算法来设计具有特定功能和结构的蛋白质分子的方法。该领域的目标是通过计算预测蛋白质的结构与功能关系,以设计出符合特定需求的全新蛋白质或优化已有蛋白质,应用广泛于药物开发、酶工程、生物材料等领域。 计算蛋白质设计的核心步骤 确定设计目标:首先明确蛋白质设计的目标,例如设计具 …

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差点失去的硕士学位,被女友拯救了(一)

原创文章,转载请注明出处。 生物硕士苦啊,2年多了。课题仍然停滞不前。 话说我是一枚研究大脑基因功能的小硕,具体研究的是大脑某神经相关基因的功能,这个基因的功能事关人的智力认知,研究好了,会造福人类,想想真是激动啊。 可想想我的研究,却一点也无法激动。实验卡住了,卡住了……,拯救愚蠢的人类不容易啊!我不想拯救了,我硕士快毕不了业了! …

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志愿者们主动感染新冠,会发生什么?

英国的研究人员近期发布了一项史无前例的研究结果,在该研究中,健康的年轻志愿者故意感染了大流行冠状病毒的早期毒株。正如预期,没有一个参与者得了重病,科学家们密切跟踪他们的症状,并对感染期间 SARS-CoV-2 水平和症状从头到尾如何变化提出了独特的见解。 图片来自:参考文献 这项最初的“人类挑战”研究的成功为未来测试 COVID-19 治疗、疫苗和病毒变体提 …

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Nature | 癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变

《Nature》最新报道了癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变。突变情况由许多过程塑造,基因区域易受突变影响,但同时受到转录偶联修复的保护。在微生物中,转录诱变产生影响,但在高等真核生物中的影响仍有待确定。ID4 -a,指的是转录相关的诱变导致一种癌症相关的插入 – 缺失 突变特征,发生短片段(2 到 5 个碱基对)的缺失 。哺乳动物中的缺陷 …

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