在Maxam 和Gilbert 发展的DNA 化学测序法(1977, 1980) 中,碱基专一性化学试剂在一种或两种特定核苷酸位置上随机断裂已纯化的3’端或5′ 端标记的DNA, 产生4 套寡聚脱氧核糖核苷酸。因为只有末端标记的DNA 片段才能在测序胶的放射自显影图中显示出来,所以只能观察到含有固定末端的片段,这样就产生了4 列DNA …
阅读更多 »缺口翻译标记DNA
下面程序描述了使用修饰染料核苷酸,用同步DNA 切割通过缺口翻译制备荧光DNA,缺口翻译是通过摸索修饰dUTP 和dTP 的荧光素或花青的最佳条件完成的(Keller 1993; Yu et al. 1994; Zhu et al. 1994) 。该方法对用四甲基罗丹明、德克萨斯红、香豆素和bodipy 修饰的核苷酸可能也适用,但染料的类型、接头、核苷酸以及 …
阅读更多 »如何制备双链siRNA?
本方案介绍如何将合成的siRNA 有义链和反义链复性形成双链siRNA, 以及利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对双链siRNA 进行分析。 试剂 丙烯酰胺: 双丙烯酰胺(19 : 1, 40%, m/V)过硫酸铵( 10%, m/V) 复性缓冲液(10 X ) 2‘ 脱保护缓冲液[100 mmol/L 乙酸,用四甲基乙二胺( TEMED) 调整pH …
阅读更多 »为什么CRISPR没有成为目前基因治疗的首选技术?
CRISPR的热度在分子生物界持续了数年,而2020年的诺贝尔化学奖授予给了两位CRISPR的奠基者,更是将CRISPR的研究热潮推上了顶峰。 CRISPR实际是(clustered regularlyinterspaced short palindromic repeats,成簇的有规律的间隔短回文片段)的简称。 1987年,科学家在大肠杆菌中发现了一段“ …
阅读更多 »普通PCR的基本原理和注意事项
1、概述 聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段。可看作生物体外的特殊DNA复制。DNA聚合酶(DNA polymerase I)最早于1955年发现,而较具有实验价值及实用性的Klenow fragment of E. Coli 则是于70年代的初期由Dr. H. K …
阅读更多 »ChIP超详细实验步骤
ChIP的一般流程: 甲醛处理细胞—收集细胞,超声破碎—加入目的蛋白的抗体,与靶蛋白-DNA复合物相互结合—加入ProteinA,结合抗体-靶蛋白-DNA复合物,并沉淀—对沉淀下来的复合物进行清洗,除去一些非特异性结合—洗脱,得到富集的靶蛋白-DNA复合物—解交联,纯化富集的DNA-片断 …
阅读更多 »利用CRISPR精确编辑过敏原基因
过敏性疾病是一个持续存在的临床挑战,治疗选择有限。因此,找到一种治疗过敏原的方法、改善过敏性疾病的技术尤为重要。 2022年1月17日,美国INDOOR生物技术公司的研究团队在《Frontiersin Allergy》杂志上发表了一篇题为 New Frontiers: Precise Editing ofAllergen Genes Using CRISPR …
阅读更多 »cDNA文库构建分为哪些阶段?
cDNA文库不同于基因组文库,被克隆DNA是从mRNA反转录来源的DNA。cDNA组成特点是其中不含有内含子和其他调控序列。从而做cDNA克隆时应是先从获得mRNA开始,在此基础上,通过反转录酶作用产生一条与mRNA相互补的DNA链,然后除掉mRNA,以第一条DNA链为模板复制出第二条DNA链(双链);再进一步把此双链插入原核或真核载体。 cDNA文库的构建 …
阅读更多 »Northern Blot原理及所需仪器、试剂
一、原理:在变性条件下将待检的RNA样品进行琼脂糖凝胶电泳,继而将在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的RNA探针进行反应。 用途:检测样品中是否含有基因的转录产物(mRNA)及其含量。 二、仪器与试剂 仪器: 恒温水浴箱,电泳仪,凝胶成像系统,真空转移仪,真空泵,UV交联仪,杂交炉,恒温摇床,脱色摇床,漩涡振荡器 …
阅读更多 »逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)
一、原理 逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)的原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR使RNA检测的 …
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