问题 可能的原因 解决办法 四条泳道同一个位置都有条带,特别是靠近引物的地方 DNA 模板不纯 观察对照DNA 是否存在同样问题,如果不存在,重新制备模板DNA 试剂不纯或试剂老化;dNTP量不足 准备新鲜试剂 DNA 聚合酶活性低 使用新鲜制备的酶。 加入更多的酶,如每个反应多加4 倍。使用前再稀释酶. 将标记反应缩减至2 min, 将T7DNA 聚合酶从 …
阅读更多 »缺口翻译标记DNA
下面程序描述了使用修饰染料核苷酸,用同步DNA 切割通过缺口翻译制备荧光DNA,缺口翻译是通过摸索修饰dUTP 和dTP 的荧光素或花青的最佳条件完成的(Keller 1993; Yu et al. 1994; Zhu et al. 1994) 。该方法对用四甲基罗丹明、德克萨斯红、香豆素和bodipy 修饰的核苷酸可能也适用,但染料的类型、接头、核苷酸以及 …
阅读更多 »验证shRNA敲除qPCR引物如何设计在靶标附近
在用 qPCR验证shRNA敲除效率 时,引物设计是非常关键的一步。你提到要“设计在靶标附近”,这个思路是对的,但还需要进一步明确几个关键点。 理解shRNA的作用机制: shRNA经过加工后变成siRNA,通过RNA干扰机制(RNAi),引导RISC复合体结合并切割目标mRNA。 切割点通常位于shRNA的互补区域中间(即靶序列中心)。 qPCR引物设计的 …
阅读更多 »分子生物学常用贮存液的配制
分子生物学常用贮存液的配制 1.30%丙烯酰胺溶液 【配制方法】将29g 丙烯酰胺和1g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。用滤器(0.45μm 孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH 值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。 【注意】丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收,其作用具累积性。称 …
阅读更多 »怎样做好荧光原位杂交实验(FISH)?
实验方法及步骤 探针变性 将探针在75℃恒温水浴中温育5 min,立即置0℃,5~10 min,使双链DNA探针变性。 标本变性 将制备好的染色体玻片标本于50℃培养箱中烤片2~3 h。(经Giemsa染色的标本需预先在固定液中退色后再烤片)。 取出玻片标本,将其浸在70~75℃的体积分数70% 甲酰胺/2×SSC的变性液中变性2~3 min。 立即按顺序将 …
阅读更多 »RNA的种类
dsRNAdsRNA 即双链RNA , 是由两条互补链复性形成的RNA 分子,可以被Dicer 酶切割形成siRNA 。 Endo-siRNAEndo-siRNA 即内源性小干扰RNA (siRNA) ,是一类存在于几乎所有真核生物中的小干扰RNA 分子。 exo-siRNAexo-siRNA 即外源性小干扰RNA (siRNA) ,是指通过体内或者体外技术 …
阅读更多 »双脱氧法和化学测序法如何选择?
双脱氧测序法速度快。引物的复性和测序可以在60~90 min 内完成。可以同时制备大量的单链或双链测序样品。如果用35 S标记的dNTP 测序,这种方法可以提供极好的(电泳)条带的分辨率。其主要缺点是模板的组成或二级结构有时会导致测序过早地终止。虽然和Klenow 片段相比,有其他的聚合酶可以减轻这个问题,但有些DNA 序列还是无法用双脱氧法精确地测出来。 …
阅读更多 »大肠杆菌电转后,4度涂抹到培养基板子上会导致死亡吗?细菌电转后是不是比细胞还脆弱啊?
这个问题问得很实际,也很关键,特别是在做质粒转化实验的时候容易遇到。 回答一:大肠杆菌电转后,4℃下操作是否会导致死亡? 不会直接导致大面积死亡,但确实会影响转化效率。 电转后的大肠杆菌处于一种“受伤”的状态,细胞膜被电击短暂打破,虽然迅速恢复,但暂时很脆弱。 如果在电转后没有及时给予复苏(比如在SOC、LB等液体培养基中摇床复苏30–60分钟),就直接在低 …
阅读更多 »RNA沉淀方法
乙醇沉淀RNA通常RNA 可以像DNA 一样沉淀。步骤1. 加入1/10 体积1 mol/L 的NaOAc (pH4. 8) 和2.5 倍体积冷的95 %的乙醇。2.-20 ℃ 下沉淀过夜。3. 用70 %的乙醇洗涤沉淀。注意:当你处理少量RNA 的时候(低于5 μg) ,在RNA 沉淀之前加入一些载体或者共沉淀物,这类物质将帮助沉淀RNA, 更容易看见沉淀 …
阅读更多 »聚丙烯酰胺凝胶电泳注意事项
聚丙烯酰胺凝胶必须由丙烯酰胺单体、聚合起始物、催化剂以及合适的盐及缓冲液的混合物聚合起来。 丙烯酰胺与BIS (N, N’ – 亚甲双丙烯酰胺)是形成胶基质的单体。 过硫酸铵启动胶的聚合过程。胶的配方要求10% 以水配制的过硫酸铵溶液。大多数资料显示需要现配现用。但是,10 %溶液可以在4℃放置数周而没有明显的活性丢失。最多配制10 …
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英格恩生物技术博客 生物实验干货分享