英格恩生物技术博客 生物实验干货分享
蛋白质结构预测（Protein Structure Prediction）是一项利用计算方法预测蛋白质分子的三维结构的技术。由于蛋白质的功能很大程度上依赖于其三维结构，预测其结构对理解生物过程、药物设计等领域具有重要意义。然而，实验确定蛋白质结构（如X射线晶体学、核磁共振等方法）耗时费力，因此计算预测成为重要替代方法。 蛋白质结构预测的主要方法 同源建模（H …
阅读更多 »移植猪心脏一周后成功下地代表了什么?
代表了全球器官移植的巨大缺口有望被填补，需要器官移植的病人能重获生机。现阶段，只有不到百分之一的人在长期等待后能获得器官移植，剩下大部分的病人只能以各种痛苦的方式继续煎熬。如果这项技术成熟，将会使我们用更少的资源挽救更多的人。 现在，这位器官接受者已经度过了最 …
阅读更多 »欧洲发现高毒性HIV变种
全球每年有超过百万的人感染艾滋病病毒，超50万人死于艾滋病相关疾病。艾滋病自发现以来，即是人类的一大威胁。 1982年，该疾病被正式命名为“获得性免疫缺陷综合征”，英文简称AIDS，也就是我们所说的艾滋病。1983年，国际病毒分类委员会确认了导致艾滋病的元凶：「人类免疫缺陷病毒」，简称HIV。在这几十年间，HIV从非洲到了美洲、欧洲、亚洲……席卷了全球，造成 …
阅读更多 »Green先生的科研生活手记(3)
巴赫与爱尔兰民谣 我戴上耳机，心情不好的时候，歌曲是我最好的，永远的朋友。我认为，唯有音乐如水晶般，没有半点瑕疵，代表人类最美好情感，最最纯净的东西， 尤其是无歌词的曲子。语言往往情感到极致，就只能大喊大叫。可曲子不用发多高的音，就能直击你的灵魂，作者住进了你心里的最底层，勾起的是你最核心，最隐秘的情感，你和他（她）能相对无语，却完全心灵相通，你能感知他（她 …
阅读更多 »Yiruma River flows in you
Yiruma（本名：李闰珉）是一位韩国钢琴家兼作曲家，他的作品《River Flows In You》是他最著名的钢琴独奏曲之一。该作品自发布以来深受全球听众的喜爱，被广泛认为是一首具有深刻情感和极高音乐美感的作品。 一、背景与创作 《River Flows In You》出自Yiruma的2001年专辑《First Love》。这首作品没有明确的歌词或文字 …
阅读更多 »NEDD4 的缺失导致小鼠完全 XY 性腺性逆转
近日，科学家发现泛素连接酶 NEDD4 在哺乳动物性别决定中的一个意想不到的新作用，调控小鼠性腺性别逆转。 性腺发育是从一个共同的前体产生睾丸和卵巢两个形态不同的器官的过程。在哺乳动物中，雄性是由 Sry 的表达驱动的。SRY上调负责启动睾丸分化的相关家族成员 Sox9，同时抑制对卵巢发育至关重要的因子。与 XY 和 XX 对照相比，这种性别逆转扩展到 XY …
阅读更多 »Nature | 癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变
《Nature》最新报道了癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变。突变情况由许多过程塑造，基因区域易受突变影响，但同时受到转录偶联修复的保护。在微生物中，转录诱变产生影响，但在高等真核生物中的影响仍有待确定。ID4 -a，指的是转录相关的诱变导致一种癌症相关的插入 – 缺失 突变特征，发生短片段（2 到 5 个碱基对）的缺失 。哺乳动物中的缺陷 …
阅读更多 »粪便菌群移植出新药丸了？
反复感染引起腹泻的艰难梭菌，是一件非常痛苦的事，对于这部分人群，粪便微生物群移植是一个不错的选择方案。来自健康捐赠者的粪便，通过结肠镜检查并研究发现了可以帮助恢复平衡的肠道微生物群落，他们可以帮忙消除潜在的致命感染。一种含有从人类粪便中分离出的细菌孢子的药丸，现在已经成功进行了 3 期试验，为首次批准此类药物铺平了道路。 艰难梭菌感染在老年患者中很常见，并且 …
阅读更多 »目前国内有哪些好的科研交流平台？
在我们的科研路上，会收藏许多的网站，检索文献的，探讨学术的，或者是求助问题的。其中，大部分人都知道的是小木虫和丁香园这两个平台。小木虫，全称是小木虫学术研究互动社区，也叫“小木虫学术科研第一站”，成立于2001年，时间较长，而丁香园论坛门槛较高，划分更细，专注于医学领域。那除了这两个，还有具备优质内容，可以让刚入实验室的初学者掌握知识，畅通交流的网站平台吗? …
阅读更多 »2024年诺贝尔化学奖之计算蛋白质设计
计算蛋白质设计（Computational Protein Design）是一种利用计算机算法来设计具有特定功能和结构的蛋白质分子的方法。该领域的目标是通过计算预测蛋白质的结构与功能关系，以设计出符合特定需求的全新蛋白质或优化已有蛋白质，应用广泛于药物开发、酶工程、生物材料等领域。 计算蛋白质设计的核心步骤 确定设计目标：首先明确蛋白质设计的目标，例如设计具 …
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