蛋白质结构预测(Protein Structure Prediction)是一项利用计算方法预测蛋白质分子的三维结构的技术。由于蛋白质的功能很大程度上依赖于其三维结构,预测其结构对理解生物过程、药物设计等领域具有重要意义。然而,实验确定蛋白质结构(如X射线晶体学、核磁共振等方法)耗时费力,因此计算预测成为重要替代方法。 蛋白质结构预测的主要方法 同源建模(H …
阅读更多 »Green先生的科研生活手记(3)
巴赫与爱尔兰民谣 我戴上耳机,心情不好的时候,歌曲是我最好的,永远的朋友。我认为,唯有音乐如水晶般,没有半点瑕疵,代表人类最美好情感,最最纯净的东西, 尤其是无歌词的曲子。语言往往情感到极致,就只能大喊大叫。可曲子不用发多高的音,就能直击你的灵魂,作者住进了你心里的最底层,勾起的是你最核心,最隐秘的情感,你和他(她)能相对无语,却完全心灵相通,你能感知他(她 …
阅读更多 »大脑与心脏连接的开端——甚至早于脊椎动物的进化起源
过去的 15 年中,科学家们探索了心脏和大脑之间的发展联系。例如,在 2010 年,研究人员发现,小鼠胚胎中分裂和分化形成心脏的细胞与喉咙和下头的肌肉细胞来自同一个细胞池,两者的关键部件的来源是有同一处。 心头连接的开端—— 海鞘? 实际上,胚胎的头心连接早于脊椎动物的进化起源,甚至可能早于头本身。研究人员在研究海鞘时偶然发现了这种联系,这种海鞘是一种水滴状 …
阅读更多 »Green先生的科研生活手记(2)
原创文章,转载请注明出处。 第二天,我兴冲冲地找到导师,告诉他有新的基因敲除的方法,还没等我说完,导师直接打断我, “你试了多少方法了,买了多少试剂了?这种方法,我怎么没有听说过?,不要瞎尝试了,你的时间不多了,看你毕不了业怎么办?! 我冷汗都下来了。 回想三年前,我从南方一所三本院校考上这所著名的研究所,面试时老师也是如此严厉,我也是冷汗直流。 话说我本科 …
阅读更多 »《倚天屠龙记》2003苏有朋版,纯音乐《爱上张无忌》解析
儿时难忘的电视剧《倚天屠龙记》,虽然最爱78郑少秋版,但03苏有朋版里的的纯音乐《爱上张无忌》,却是相当具有东方韵味,经常被我循环播放,让人浮想翩翩。试解析如下: 一、背景与风格 音乐风格:融合了古风与现代配器,被很多表现中国古代的作品作为BGM(背景音乐)。 创作背景:虽然没有官方详解,但曲名《爱上张无忌》显然是借用了金庸小说《倚天屠龙记》中的男主角“张无 …
阅读更多 »2022的七大热点技术: 靶向基因治疗、空间多组学……
1.完全基因组 在去年5月发表的预印本中,人类共有基因组序列 GRCh38 添加了近 2 亿个新碱基对,并撰写了人类基因组的最后一章。 GRCh38 于 2013 年首次发布,一直是一个有价值的工具,但也存在漏洞。主要是因为测序技术产生的读数准确但较短。它们的长度不足以明确地绘制出高度重复的基因组序列,包括覆盖染色体末端的端粒和在细胞分裂过程中协调新复制的 …
阅读更多 »粪便菌群移植出新药丸了?
反复感染引起腹泻的艰难梭菌,是一件非常痛苦的事,对于这部分人群,粪便微生物群移植是一个不错的选择方案。来自健康捐赠者的粪便,通过结肠镜检查并研究发现了可以帮助恢复平衡的肠道微生物群落,他们可以帮忙消除潜在的致命感染。一种含有从人类粪便中分离出的细菌孢子的药丸,现在已经成功进行了 3 期试验,为首次批准此类药物铺平了道路。 艰难梭菌感染在老年患者中很常见,并且 …
阅读更多 »偶听李斯特的《第三号爱之梦》(Liebesträume No. 3 in A-flat major, S. 541/3),试着解读一下
偶听李斯特的《第三号爱之梦》(Liebesträume No. 3 in A-flat major, S. 541/3),试着解读一下。 一、历史与文化背景 1.1 创作背景 李斯特于1845年左右创作了《爱之梦》三首,这组作品最初是为声乐和钢琴而写的艺术歌曲(Lied),歌词取材于德国诗人费迪南德·弗雷利格拉特(Ferdinand Freil …
阅读更多 »甜味使我们获得能量,苦味提醒我们潜在的毒性,酸味其实是……
原来动物也能尝到酸味 咬一口柠檬,你可能会体验到一种强烈的感觉:直击大脑的刺激、令人垂涎的酸味和令人愉悦的气味。作为五种主要口味之一的酸味在生活中十分常见(酸味、甜味、咸味、咸味和苦味)——但科学家们对酸味是如何演变的知之甚少。最近发表在英国皇家学会学报的一篇论文,探讨了酸味的起源与作用。 很多物种在进化过程中失去了大多口味。比如海豚除了咸味之外,似乎没有任 …
阅读更多 »明天课题组开例会,已经开始焦虑了怎么办?
大部分课题组都有例会的规定,学生每周都需要轮流向课题组汇报自己的实验进展,还没有开展实验的学生就汇报文献。导师通常是非常忙碌的,这个时候是学生得到他们关注的宝贵时刻。 课题组例会传统的形式:一名实验室成员会就他们的研究发表演讲,而其他人则会提出问题并给予反馈。在这个过程中,对导师来说可能很有趣和令人兴奋。但实际上,除了演讲者和导师,很少有人参与讨论。 不得不 …
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英格恩生物技术博客 生物实验干货分享