2022年 1月 28日, 星期五
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病毒感染细胞实验整体流程

目的基因不能直接整合到大多数真核细胞,常用的手段是将目的基因包装成病毒来感染细胞,从而得到表达满足实验需求。病毒有很多种,常见的有慢病毒和腺病毒。关于慢病毒和腺病毒的原理以及特别前面的文章中都有介绍过,可以搜索关键字查看。今天主要介绍病毒感染细胞的实验流程。

1.构建目的基因到载体

  • 构建手段

一般是根据原始质粒信息确定克隆方案,有以下两种手段。

1)如果原始质粒与载体有匹配酶切位点,采用相应的内切酶切下相应片段,回收并连接到载体,酶切,并测序鉴定

2)如果没有匹配的酶切位点,则设计带有特殊接头的引物进行PCR扩增,得到目的片段,采用相应的内切酶切下相应片段,回收并连接到穿梭载体,酶切,并测序鉴定

  • 质粒载体

1)概念

能够进行自主复制的环状DNA双链结构,包括真核生物的细胞器(主要指线粒体和叶绿体)中和细菌细胞拟核区以外的环状脱氧核糖核酸(DNA)分子

2)特征

质粒上常有抗生素的抗性基因,例如,四环素抗性基因或卡那霉素抗性基因等。有些质粒称为附加体(episome),这类质粒能够整合进真菌的染色体,也能从整合位置上切离下来成为游离于染色体外的DNA分子。质粒在宿主细胞体内外都可复制。通过个些特性,人们可以把一些目的DNA片断构建在质粒中,通过转化入大肠杆菌中,利用选择培养基来筛选从而不断的复制,来得到目的产物。

2、质粒DNA在大肠杆菌里转化

连接上目的基因的质粒转化大肠杆菌是为了让目的基因在大肠杆菌里扩增,然后提取质粒,以下是质粒DNA在大肠杆菌里转化的三步骤。

  • 大肠杆菌感受态细胞的制备

1)从大肠杆菌平板上挑取一个单菌落于3mlLB培养基的试管中,37℃振荡培养过夜。

2)取0.4ml菌液转接到40mlLB液体培养基中,37℃振荡培养2~3h

3)菌液转移到50ml离心管中,冰上放置10min

4)4℃离心10min(4000r/min)

5)倒出培养液,将管口倒置以便培养液流尽

6)用冰浴的0.1mol/L氯化钙10ml悬浮细胞沉淀,立即冰浴30min

7)4℃离心10min(4000r/min)

8)倒出上清液,用冰浴的0.1mol/L氯化钙2ml悬浮细胞(冰上放置)

9)分装细胞,200ul一份,4℃保存

  • 质粒DNA的转化

1)取200ul新鲜制备的感受态细胞,加入质粒DNA2ul混匀,冰浴30min

2)离心管放到42℃保温90s

3)冰浴2min

4)每管加800ulLB液体培养基,37℃培养1h(150r/min)

5)取适当体积(100ul)的复苏细胞,涂布在选择性培养基上,正置30min

6)倒置平皿37℃,12~16h,出现菌落

  • 质粒提取步骤

1)取1~4ml在LB培养基中培养过夜的菌液,12000转离心1min,弃上清

2)加250ul溶液Ⅰ/RNaseA(溶液Ⅰ为细胞悬浮液)混合液,漩涡剧烈振荡直至菌体完全重新悬浮,室温静置1-2min。

3)加入250ul溶液Ⅱ(细胞裂解液),轻柔的反复颠倒混匀5-6次。室温放置1-2min,使菌体充分裂解,直至形成澄清的裂解溶液。

4)加入350ul溶液Ⅲ(中和液),立刻轻柔地反复颠倒混匀5-6次,此时会出现白色絮状沉淀。

5)12000室温离心10min,收集上清。

6)将上清置于DNA纯化柱中,静置1-2min。

7)12000转离心1min,弃滤液。

8)加入500ul溶液PB(洗涤液)12000转离心1min,弃滤液,目的是将硅胶膜上吸附的蛋白、盐等杂质洗脱,以获得高质量质粒DNA。

9)加入500ul溶液W(去盐液),12000转离心1min,弃滤液,重复一次。

10)12000转离心3min,以彻底去除纯化柱中残留的液体。

11)将DNA纯化柱置于新的离心管中,悬浮滴加50-100ul溶液Eluent(为无菌的双蒸水,PH为8.0-8.5),室温放置2min。

12)12000转离心1min,此时管底即为高纯度的质粒DNA,质粒于-20℃保存。

质粒提取步骤:吸取液体培养基于1.5ml离心管中12000转离心1min,弃上清,吸取培养基重复离心弃上清离心,留取少量菌液作为菌种保存,可直接置于-20℃——加250ulBufferS1悬浮细菌,悬浮均匀——加250ulBufferS2温和充分的上下翻转4-6次混合均匀,使菌体裂解——加350ulBufferS3温和上下翻转12000离心10min——取上清液转移到专用的制备管(2ml)12000转离心1min,弃滤液——加500ulBufferW112000转离心1min,弃滤液——加500ulBufferW212000转离心1min,弃滤液,重复一遍——将制备管置回2ml离心管12000转离心1min——将制备管移入新的1.5ml离心管中,加60~80ulEluent或离子水,室温1min12000转离心1min——移去制备管,将有质粒的离心管于4℃或是-20℃保存

 

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