蛋白质结构预测(Protein Structure Prediction)是一项利用计算方法预测蛋白质分子的三维结构的技术。由于蛋白质的功能很大程度上依赖于其三维结构,预测其结构对理解生物过程、药物设计等领域具有重要意义。然而,实验确定蛋白质结构(如X射线晶体学、核磁共振等方法)耗时费力,因此计算预测成为重要替代方法。 蛋白质结构预测的主要方法 同源建模(H …
阅读更多 »甜味使我们获得能量,苦味提醒我们潜在的毒性,酸味其实是……
原来动物也能尝到酸味 咬一口柠檬,你可能会体验到一种强烈的感觉:直击大脑的刺激、令人垂涎的酸味和令人愉悦的气味。作为五种主要口味之一的酸味在生活中十分常见(酸味、甜味、咸味、咸味和苦味)——但科学家们对酸味是如何演变的知之甚少。最近发表在英国皇家学会学报的一篇论文,探讨了酸味的起源与作用。 很多物种在进化过程中失去了大多口味。比如海豚除了咸味之外,似乎没有任 …
阅读更多 »为什么RNA疗法的研究很多,药物却很少?
mRNA疫苗的成功上市,让RNA疗法的研究再次成为科研界的焦点。 一直以来,小干扰RNA(siRNA)都是RNA研究的热点,它能够在多个水平实现基因的表达沉默,靶向治疗多种疾病。其实,除了基因沉默,还有可以激活目标基因表达的RNA技术,也就是RNA激活(RNAa),具有这种功能的RNA被称为小激活RNA(saRNA)。对于肿瘤免疫、代谢疾病来说,将saRNA …
阅读更多 »差点失去的硕士学位,被女友拯救了(二)
原创文章,转载请注明出处。 正当我兴致勃勃准备去找导师说试剂的事,舍长突然来电了。 “喂,你搁哪儿呢,快来园艺学院201,急事,特急!”还没等我说好,电话就被挂了。 这语气听起来倒是挺急的,我也不耽误,赶紧去救我舍长于水火之中。 毕竟,明早还得仰仗他给我带早饭呢。 火速蹬着自行车到了园艺楼,跨步上了楼梯,冲到201门口:“舍长,我来了!“ “快,来帮我整死这 …
阅读更多 »移植猪心脏一周后成功下地代表了什么?
代表了全球器官移植的巨大缺口有望被填补,需要器官移植的病人能重获生机。现阶段,只有不到百分之一的人在长期等待后能获得器官移植,剩下大部分的病人只能以各种痛苦的方式继续煎熬。如果这项技术成熟,将会使我们用更少的资源挽救更多的人。 现在,这位器官接受者已经度过了最 …
阅读更多 »Nature | 癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变
《Nature》最新报道了癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变。突变情况由许多过程塑造,基因区域易受突变影响,但同时受到转录偶联修复的保护。在微生物中,转录诱变产生影响,但在高等真核生物中的影响仍有待确定。ID4 -a,指的是转录相关的诱变导致一种癌症相关的插入 – 缺失 突变特征,发生短片段(2 到 5 个碱基对)的缺失 。哺乳动物中的缺陷 …
阅读更多 »欧洲发现高毒性HIV变种
全球每年有超过百万的人感染艾滋病病毒,超50万人死于艾滋病相关疾病。艾滋病自发现以来,即是人类的一大威胁。 1982年,该疾病被正式命名为“获得性免疫缺陷综合征”,英文简称AIDS,也就是我们所说的艾滋病。1983年,国际病毒分类委员会确认了导致艾滋病的元凶:「人类免疫缺陷病毒」,简称HIV。在这几十年间,HIV从非洲到了美洲、欧洲、亚洲……席卷了全球,造成 …
阅读更多 »2024诺贝尔化学奖得主David Baker和他的Rosetta模型
Rosetta模型是一套用于蛋白质结构预测、分子对接和设计的计算工具集,由2024年诺贝尔化学奖得主,华盛顿大学David Baker教授的实验室开发。Rosetta最初被设计用于蛋白质结构预测,但如今已发展成一套多功能的平台,被广泛应用于蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质和蛋白质-小分子相互作用、以及新蛋白质设计等领域。 Rosetta模型的核心功能 1.蛋白质 …
阅读更多 »拯救了全球猪产业的冠状病毒变种历史,是否可以重现?
早在1946年——普渡大学的兽医研究人员发现,一种可怕的病毒入侵幼猪内脏的东西会导致幼猪腹泻、呕吐和体重减轻,最终导致大多数猪死亡。当时科学家们并不知道这种疾病的原因,这种疾病摧毁了美国的养猪场,事实证明,这种养猪户的噩梦是一种冠状病毒,被命名为传染性胃肠炎病毒 (TGEV)。 1970 年代,TGEV在世界范围内传播,过程中发生了一个奇怪的转变:TGEV出 …
阅读更多 »大脑与心脏连接的开端——甚至早于脊椎动物的进化起源
过去的 15 年中,科学家们探索了心脏和大脑之间的发展联系。例如,在 2010 年,研究人员发现,小鼠胚胎中分裂和分化形成心脏的细胞与喉咙和下头的肌肉细胞来自同一个细胞池,两者的关键部件的来源是有同一处。 心头连接的开端—— 海鞘? 实际上,胚胎的头心连接早于脊椎动物的进化起源,甚至可能早于头本身。研究人员在研究海鞘时偶然发现了这种联系,这种海鞘是一种水滴状 …
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