你遇到的这个问题在慢病毒(lentivirus)介导的RNA干扰实验中其实挺常见,下面我们逐步分析下可能的原因: 实验现象简述: siRNA转染敲得很有效(蛋白水平明显降低); **将siRNA序列构建进慢病毒(shRNA形式)**后感染细胞; 荧光表达很强(说明病毒成功进入细胞,且有表达); 但目标蛋白并未敲低,几乎没有 knockdown 效果。 可能原 …
阅读更多 »逆转录病毒可以共感染吗?
可以。逆转录病毒(如MLV、lentivirus等)可以共感染同一细胞,尤其是不同病毒包装不同的转基因载体时,可以实现共转导(co-transduction),从而使同一细胞获得多个基因。 但要注意: 病毒滴度足够高:每个病毒的MOI(Multiplicity of Infection)需要合适,才有可能让同一细胞被两种病毒都感染。 标记或选择机制清晰:常用 …
阅读更多 »测定病毒滴度,是否可直接使用 293 细胞?
测定病毒滴度时,是否可以直接使用 HEK293 细胞,取决于你使用的病毒类型和实验目的。 一般来说: 如果是腺病毒或慢病毒,HEK293 细胞(特别是 HEK293T 细胞)通常是不错的选择,因为它们表达病毒包装过程中需要的辅助因子(如腺病毒的 E1A/E1B 或慢病毒的 VSV-G),可以有效地被感染并产生明显的病毒效应。因此,很多实验室会用 293 细胞 …
阅读更多 »在慢病毒滴度测定的倍比稀释实验中,为什么计算滴度时好像没用上复孔?
通常,在计算滴度时,我们会选取某个稀释度的特定数据(如阳性细胞数),但这个数据往往是复孔的平均值,或者用于确认某个稀释度的数据是否可靠。因此,虽然计算公式中可能未直接体现复孔的作用,但复孔实际上已经在前期数据处理中起到了关键作用。 总结:复孔的作用是提高数据的稳定性和准确性,即使计算滴度时没有直接体现,实际上已经通过平均值计算、异常值排除等方式间接影响了最终 …
阅读更多 »AAV病毒感染,tu/ml和vg/ml 的单位如何 换算
在AAV病毒感染实验中,TU/mL(转导单位每毫升,Transduction Unit per milliliter)和vg/mL(病毒基因组拷贝数每毫升,Viral Genome copy per milliliter)是两种常见的病毒滴度单位。它们表示的是病毒浓度的不同方面: TU/mL:代表的是真正具有转导能力的AAV颗粒的数量,也就是能够在宿主细胞中 …
阅读更多 »嘌呤霉素筛选标记的病毒滴定 Protocol
关于使用嘌呤霉素筛选标记的慢病毒或逆转录病毒进行病毒滴定的 protocol,整理了一个常用且较为权威适用于慢病毒系统: 【嘌呤霉素筛选法的病毒滴定 Protocol】 原理简述: 将病毒感染宿主细胞,使用嘌呤霉素筛选,仅有成功整合了抗性基因的细胞能存活。最后通过计数存活细胞(克隆或整体密度)来估算病毒滴度。 实验材料: 病毒上清; HEK293T 或其他易 …
阅读更多 »病毒感染细胞效率低怎么办?
病毒感染细胞本来效率就较低,一定要注意以下几点:1.感染时的培养基尽量少些;2. 使用Envirus-LV,可以提高感染效率20-50倍。 病毒感染细胞本来效率就较低,整个过程相对复杂难操作,一般一次花费周期至少两三个月,多则几个月到十几个月不等,经费也是几万到十几万。万一实验失败需要重复操作会花费更多的时间和开支。所以有效提高病毒转染效率是病毒转染细胞的关 …
阅读更多 »293T分别包装两种病毒,浓缩后混合感染鼠CD8+ T细胞可以吗?
原则上可以,具体要看以下几个条件: 步骤可行性: 分别包装:在293T细胞中分别转染两种构建(比如psPAX2 + pMD2.G + 各自的载体),收集病毒上清; 浓缩:超速离心或PEG浓缩,两种病毒分别处理; 混合感染:感染前混合两种浓缩后的病毒,用于感染小鼠CD8+ T细胞。 技术要点: T细胞激活:CD8+ T细胞对逆转录病毒天然不易感染,通常需要先用 …
阅读更多 »慢病毒滴度测定的倍比稀释实验中,设置复孔的作用?
在慢病毒滴度测定的倍比稀释实验中,设置复孔主要有以下几个作用: 提高实验数据的可靠性由于生物实验存在一定的随机误差,复孔可以减少实验数据的偶然性,提高测量的准确性和重复性。 计算平均值,减少误差即使计算滴度时可能未直接用到每个复孔的数据,而是取某个稀释度下的阳性孔(如GFP阳性细胞数或抗生素筛选存活细胞数),但通常会计算复孔的平均值,以降低误差。 观察实验一 …
阅读更多 »慢病毒感染后多长时间换液和多长时间检测?
在慢病毒感染的实验中,通常的做法是,在感染后24小时更换培养液,目的是去除未吸附的病毒和残留的病毒介质,避免对细胞的毒性影响。更换培养液后,细胞会继续培养,通常会保持培养在常规的全培液中。 对于延长观察时间的问题,感染后72小时一般是观察慢病毒感染效果的一个标准时间点,因为大多数慢病毒的转导效率在72小时内达到峰值。尽管感染后24小时更换培养液,但并不意味着 …
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