文献标题:QBEmax is a sequence-permuted and internally protected base editor
期刊:Nature Biotechnology
影响因子:33.1(2024年)
文献概要:
胞嘧啶碱基编辑器(CBE)显示出多重基因敲除应用的前景,但不纯的编辑、插入和脱靶仍然经常发生。我们在这里描述了QBEmax,它表现出高效率、低indel和脱靶以及高产品纯度,其中高达99.8%的编辑由C-to-T组成。通过分子动力学建模,QBEmax作为一种紧凑稳定的碱基编辑器,保护受保护的碱基免受不希望的修复过程的影响。
使用英格恩(Engreen)产品的实验部分:
在Jurkat细胞中,使用Entranser-E(英格恩生物) 和 Lonza 4D-Nucleofector 系统(程序DS167)共转染了QBEmax或BE4max编辑器质粒及5个sgRNA质粒。
实验意义:
本研究开发了QBEmax——一种通过结构域重排和内部嵌入脱氨酶的新型碱基编辑器(CBE)。其重要意义包括:
- 高纯度编辑:C-to-T编辑纯度高达99.8%,显著减少C-to-G/A等非目标编辑;
- 低indel率:平均indel频率降低约56.5%;
- 宽编辑窗口:可编辑PAM远端至C16位点,扩展了可编辑范围;
- 低脱靶效应:在DNA和RNA水平均表现出更低的脱靶活性;
- 适用于多重基因敲除:尤其在CAR-T细胞治疗中,可同时高效敲除多个免疫相关基因(如PD-1、CISH、TRAC等),提升治疗效果和安全性。
总结:该研究不仅提出了一种新型高性能碱基编辑器QBEmax,还通过英格恩的Entranser-E转染试剂在Jurkat细胞中验证了其高效性和安全性,为多重基因编辑治疗(如CAR-T疗法)提供了强有力的工具,具有重要的临床转化潜力。
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